ゼノブレイド2のラストでホムラとヒカリが復活しますが、記憶を消去されたブレイドですよね？それとも天の聖杯は特別でレックス達の事は憶えているのですか？

消去されていませんよ。 作中で説明されているようにホムヒカとメツは特殊で コアクリスタルに情報が保存されていて、 ホムヒカ＆レックスの場合はレックス側のコアクリスタルが バックアップのような役割を果たしているので 全て覚えています。