アインソフオウルとリオへの対応の違い、状況を考慮すると、アインソフオウルは既に無力化されてるけど、リオの場合は生徒会長で反撃される可能性があるからとかじゃ無いですか。
あの状況でリオを肯定したり寄り添うと、先生自身の行動は問題無かったのかって反省や責任追求のターンが来る可能性があり、更にアリスの安全を脅かされる危険があるので、徹底的にリオが悪い事にして突き放したんじゃ無いですかね。
…物凄く露悪的な見方ですけど。
メタ的に言うと、真面目に責任を取り始めると権力が強過ぎる先生をソシャゲ主人公として動かせなくなるので、先生には拒否できない地道な日常業務が発生する責任を負わせないようにストーリーを構築するしかなくなるんじゃないでしょうか。