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日向ねこ
日向ねこ
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日向ねこ
@nekotatsusan3
研究者です。東工大数学
情報科学分子生物学バイオインフォ薬学Ph.D(DC1/早期卒業)SystemsBiology@トロント大AI創薬@日○中央研究所精神神経疾患/老化研究(研究所所長@ R社)。Wet/Dry両方します。友達は猫のひなとたま。Vtuber/理学書/研究が好きです。
情報科学分子生物学バイオインフォ薬学Ph.D(DC1/早期卒業)SystemsBiology@トロント大AI創薬@日○中央研究所精神神経疾患/老化研究(研究所所長@ R社)。Wet/Dry両方します。友達は猫のひなとたま。Vtuber/理学書/研究が好きです。日向ねこ🌙’s posts
一部の博士の学生は、結果も論文も出さず、更にどんなに叩かれても平然としてる。
最終的には周りが諦めてラボから追い出すために博士号をとらす。
この場合、Ph.d(根性)とかにして欲しい。
研究者が国に「研究させて下さい」みたいな感じで申請書出すという構図がもう嫌い。
せめて申請書書いた時点で幾らか作業代出してよ。
絵師さんに絵をお願いして「不採用です」とか言って代金払わないみたいなもんでしょ。
博士課程は指導してもらえる最後のチャンスだと思ってたけど、アカハラで全て終わりましたね。何も習ったことないです。
まぁ何も教えないこと自体が指導とか思う人もいそうですが、流石に無責任すぎるかなと思ってます。
研究者が自腹きって研究してる現状、終わりの始まり感が凄いんだよな。
段々自腹きる人が減って研究が立ち行かなくなる。
いよいよ研究が出来ない国となり、技術や知識は外国から輸入することに。明治初期みたいな。
しかしお金が無くなればそれも出来ず後進国になる。
いや流石にどこかで気付くか
あまり酷いことは言いたくないんだけれど、モル数求められない受験生に化学の問題の解説をするの不可能すぎだった
しかもなんか途中から不機嫌そうになり、勘弁してくれって感じだった。
どうすんだよコレ。
しかもなんか途中から不機嫌そうになり、勘弁してくれって感じだった。
どうすんだよコレ。修論までは研究テーマに関して自分より詳しい人がいるかもしれなかったけど、博論に関してはもう自分が世界で1番詳しい状態。
なので、博論発表会の質疑応答は修論のときより簡単だった印象。
誰がデータ消したか分からないけど、仕方ないからもう一度とっておいたDNAを業者に出すかと思って、冷凍庫みたらサンプルまで無くなってた。
聞いたら、私が8月末で退職するので、もう廃棄したらしい。
もう実験し直しも出来ない。共同研究も終わるかも。呆れて言葉も出ないよ。
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日向ねこ
@nekotatsusan3
NGSデータ「俺……消えっから！」
私も消えたい。 x.com/nekotatsusan3/…
「大学院では答えを与えるのではなく考えさせるのが大事」
みたいに良く言われるけど、考えたところで「これが答えか！」にはならない。
なので大事なのは「自信を持てるようになる」ことと「ディスカッションして自分が思った答えで相手を納得させることができる知識量と技術」なんですよね。
「1コインRNAseq」の研究申請書、落ちてました。
たった200円でRNAseqが出来るようになるんだよ？実現させたくない？どうして...
負け犬の遠吠えになるけど、見る目ないなぁ
まぁどこか別の国や別機関で開発しようと思います。国の手柄にはならないけど、もういいよね！
負け犬の遠吠えになるけど、見る目ないなぁ
まぁどこか別の国や別機関で開発しようと思います。国の手柄にはならないけど、もういいよね！本日も教授と論文ディスカッションした。
解析と文章と進捗スピードめっちゃ褒められて自己肯定感あがった。
最後にラボのJKになって欲しいとお誘いをうけたのですが、待遇が微妙なので踏ん切りがつかない。
性格と能力はアカデミアの研究者向きなんだろうけど、慎重に人生計画立てないとまずそう。
「そういえば私教授になったよー」とアカハラ准教授が言ってたらしいんだけど、教授になりたくて仕方なかったくせに「そういえば」とか言うあたり相変わらずプライド高いんだなと思った。
そういう学生、私が学生だったときにも居た。しかも博士課程。
教授が代わりに論文書いてあげて、とにかく早く卒業(追い出す)させてた。
今の時代すぐハラスメントになるから仕方ないけれど、教授可哀想だったし博士号の価値も下がるし、良いことない。。。 x.com/PI_in_abroad/s
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バイオ実験、スゴロクみたいに延々と突然のループに入って数ヶ月余裕で溶けることあるよね。
タンパク精製とかそうだった。
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いいみっちゃん
@padfoot_iimi
PCR沼にハマりそうな予感がしている
研究は自分の人生で終わるような些細なものじゃなくて、過去の研究者から受け継ぎそして後継者へ引き継ぐもの。
だから研究者は半分位は教育者と言っても過言ではない。後を継ぐものを育てる必要がある。
この観点から見ると、研究者の評価は業績云々以前に部下からの評価を加えるべきだと思ってる。
前も言ったんですけど、アカデミアの環境が悪い大きな要因の1つとして、現在の環境で良しと思ってる研究者がいることが挙げられると思うんですよね。
修行と思って自分に厳しくするのは勝手ですが、それは自分の中だけにしまっておいてほしいですね。
私程度で良ければ「バイオインフォ初めてでどうしよう」って人の質問にzoomとかで答えますよ。
RNAseqやpython環境構築くらいならお手伝い出来ると思います。
昨日一昨日はやりたいことしかやらなかった。
RNA-Seq Data 2500件ほどDLしてcount→標準化。発現量行列にして標準化してから相関係数行列(絶対値をとってある)作成してheatmap。
異なるRNA-Seqデータでも発現が相関している遺伝子の組がそれなりにあることが分かった。これが知りたかったんだよ！
同僚のデータ消したりサンプル捨てたりするような環境にいるのがいけないんですよね。
9月からは民度が良いと思われるところで働けるので、そこでまた頑張ります。
それにしても疲れた。たっぷり寝たけどまだ疲れがとれない。
RNAseqの解析程度でマウントとってくる奴は元からいらないし、バイオインフォマティシャンですらない。
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アラフォーバイオ系(ダークサイド)
@osYZtdWoeHsph6C
ChatGPTに教えてもらい、RNAseqをほぼほぼ一人で解析し終えた。ウエットしかできないバイオ屋の私がだ。
いちいちマウントとってくる隣の建物のバイオインフォマティクス野郎に
”お前はもう要らない”
と告げる日は近い。
M1の時にまさにコレがあった。指導教員が文字通り顔真っ赤にして1時間程ずっと怒鳴られました。
私は別の仮説を思いついていてそれについて話したくてワクワクしてたのにトラウマになりました。
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サクセスリバーコーテシーinエイトプリンス
@rei_nari
仮説を否定するデータを出したら怒られるとかいう世界、怖すぎる。。実験がしっかりと成立している上で、仮説が否定されるなら、仮説を棄却して新しい仮説を練り直さないとだよね。。
昨日は元居たラボの教授と2人で夕飯を食べました。
そしたらサプライズで、私の転職祝いのケーキを用意してくれていました。
一昨日は勝手にデータ消されたりサンプル捨てられたりして、もう人間嫌い状態になってたのですが、このサプライズでやっぱり良い人はいるんだなぁと思えました。嬉しい！
前職でNGSのサンプル捨てられてデータも消されたんだけど、さっき偶然にスパコンの中にバックアップがあったのを見つけた。
バックアップとってないはずないと思ってたんだけど、何故か見つからなくて、でもやっぱりあった。
よかったわ。
学内のハラスメント相談室が教授達と繋がってるとか言うけど、私は教員と面と向かって「あなたを訴えます。」と武士のように宣言をした上で訴える活動開始したから、私に限っては繋がってようが関係なかったな。
ご丁寧に該当教員の上司にも「これからあなたの部下を訴えます。」と宣言したし。
私が尊敬してるアカデミアの教授は、グラント書きも大学教務もやりながら、バリバリ実験してますね。
しかも実験が上手いんだなー！
データ解析を私が担当してるけど、データがホント綺麗。
私も実験主義にはそれなりに自信あるけど、この先生には敵わない。
ラボに配属された最初の日、帰っていいよと言われたところ帰らずに「ピペットマンの練習してもいいですか？」と言ったのを思い出した。
電子天秤の上に水入れたビーカーをのせて、ピペットマンで吸い上げた体積と同じだけ重さが減るか繰り返していた。
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圧倒的に成長したぬーとりあ☆はかぴばら☆と区別できない（極悪令嬢・圧ヌ一ちゃん）
@piyota0
実験系の生命系の研究室では、実験しない限り新規のデータは得られず、訓練しない限り実験の手技は向上せず、つまり最初の何週間か何か月かは失敗ばかりであっても実験台に向かい続けなければ、卒業・大学院修了は難しいということ。なので、字義通り就活しかしない学生は卒業・修了は困難なのだ。
大企業の研究職からベンチャーの研究職に転職しようか迷ってるんだけど、パートナーは「どちらの選択をしてもいいよ」と応援してくれていて感謝しかない。
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ぽす毒
@vetpostdoc
海外に挑戦するって大変だけど、覚悟みたいな中二病ワードでドヤる前にまずは家族のサポートに感謝しよう。
ぽす毒はメリーランドからシカゴに移るとき、妻は既に貰っていた大学院のオファーを蹴ってついてきてくれた。だから彼女がこの先やりたい事は全てサポートするし、感謝の気持ちは生涯忘れん。
私、個人事業主で一応会社やっているのですが、今日初めて案件を取れました
嬉しい
会社立ち上げ/契約書/仕様書作成など色々分からなくて、あと本業が忙しいかったり体調が悪かったりして、1.5年位活動なし状態でしたが、やっと一歩進めました。
9月以後死ぬ程忙しくなりそうですが、頑張ります
嬉しい
会社立ち上げ/契約書/仕様書作成など色々分からなくて、あと本業が忙しいかったり体調が悪かったりして、1.5年位活動なし状態でしたが、やっと一歩進めました。
9月以後死ぬ程忙しくなりそうですが、頑張ります身体や精神が思ったようにコントロールが効かない人も多いんですよ。健康なのはレア。
そういうハンデがないんだろうなって人に限って根性だの覚悟だの言ってて草生えない。
もっと謙虚に「自分は健康でラッキーだった」くらいに留められないもんなんですかね。
グラントの書類選考、不採択だったけど、不採択の中でも上位20%だったらしい。
不採択は悲しいけど、嬉しかった。
フィードバックのコメントで何が至らなかった点かも良くわかったし、次は必ず取る。
国の公募に応募して研究費獲得にチャレンジして研究してみたいけど、例えば
・研究機関に所属してない
・研究者番号を持っていない
・所属機関とは別に個人で好きなテーマを申請したい
・事務や上司とのやりとりが面倒
等の理由で悩んでる方がいましたらリプかDM下さい。お手伝い出来るかもです。
#研究を始めたきっかけを知りたいです
中1の頃、数学でどんどん(再)発見を重ねて、研究が得意かも？と思いました。
それで東工大の数学科に行きましたが、超人が沢山居て太刀打ち出来ないし、純粋数学より応用数学が好きなことに気づいたので、数学が絡んだ学際分野を目指すことにしました。
先日、遺伝子発現とは何ですか？というアンケートしたけど、mRNA量と答えた人がかなりいた。
mRNA量が多くても翻訳効率が低くて全然発現が低いこともある。なのでmRNA量ではないはず(間違ってたらすみません
こんな論文もあるんだぞ↓
nature.com/articles/s4158
家庭教師やってて思うんですけど、やっぱ教えるのが好きなんですよね。そっち方面に転向しようかなぁ。
研究も好きだし向いてるとも思うんですけど、実は研究者に好きになれないタイプがかなり多くて、だから残念だけど研究者はあまり向いてないのかなとも思い始めてるんですよね。
ブログにアカハラの詳細記事載せてたら大学から「アカハラ教員が被害を受けており、また、大学への名誉毀損になるので、削除して下さい。」と連絡きましたね。
その時は色々余裕無かったので記事を非公開にしたけど、いずれちゃんと公開するんでヨロシクな。 x.com/norinori1968/s
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私もRNAseqといくつかのオミクスを含めて、そしてpythonの基礎と機械学習深層学習の本出したいなぁ。awsやスパコンの使い方も伝えたい。
一方で実験プロトコールもしっかり説明したい。
本って誰かに「本書きたいです！」で始まるのかな？それとも出版社からのヘッドハンティングなのかな
あぁ、それは許されない、許さなれないよ。
私もmilliQってラベルのボトルに誰かが泳動バッファーの残り突っ込んでたことがあって、3日かけて精製したサンプルがおじゃんになったことがある。
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ቻ ቻ ቻ ቻ ቻ ቻ ቻ
@tommy_devo
100%エタノールって書いてあったチューブの中身が70%エタノールだったっぽい
ｺﾛｽ
大学教員が社会に出たかどうかみたいなツイート散見されるけど、私の指導教員()は学生の頃からおそらく25年近く同じラボにいる。
これは流石に社会に出てない扱いで良いと思う。
STAP細胞が発表されたとき、確かM1だったような。
捏造も酷かったけど、笹井先生が自殺してしまったことが悲しかったな。
自殺の半年前に神戸の理研でお話しさせて貰ったことがあり、どんな話題振っても付いてきてくれる、とても頭の良い先生だったんだよ。
この前プログラミング未経験の人にpythonを使いそうな機能に絞って一通り教えたんだけど、(物凄い詰め込んで)5-6時間で済んだ。
環境構築と実行方法から変数や制御構造、ファイル入出力、関数クラス等の基本的な文法に加えてpandasとnumpyを扱った。
案外早く終わったという印象。需要あるかな
すまん、元上司と大喧嘩したわ。
元上司のスケジュール管理についてスラックで苦言呈したらスラックと口頭で猛反発してきたので、そのままオフィスでみんな聞こえるレベルでの言い合いになった。