In diesem Prozeß kam auch das Schicksal der jüdischen Gemeinde von Chania zur Sprache. Die Juden waren seit vielen Jahrhunderten in der alten Hafenstadt ansässig, die meisten von ihnen Nachfahren spanischer Juden, die Ende des 15. Jahrhunderts vor der Inquisition geflüchtet waren. Von dem harmonischen Zusammenleben von Juden und Christen in Chania erzählt so manches alte kretische Volkslied, wie das von der schönen "Ovriopoula", dem Judenmädchen, das einen Christen liebt und ihn gegen den Widerstand der Geistlichkeit schließlich heiratet.
