少年探偵団は『仮面ヤイバー』に登場する猫にそっくりなトラカゲがボロボロの紙をくわえているのを発見。その紙は「シオリ」という少女からのSOSだった!一方、佐藤刑事と高木刑事は、その少女の誘拐犯を追跡していたが、神奈川県に入ったところで見失う。居合わせた神奈川県警の萩原千速は、犯人が赤レンガ倉庫に逃げ込む姿を目撃。米花で聞き込みするコナンと、横浜で誘拐犯を追跡する千速。二拠点での救出作戦がいま始まる!