- 100 sequences selected
- Job Title
-
ref|NZ_JAAQGR010000049.1|
- RID
- JSUUCVFD014 Search expires on 12-01 23:05 pm
- Program
- BLASTN
Help
Program version: BLASTN 2.17.0+
- Database
-
nt
-
See details
Title:Nucleotide collection (nt)
Description:The nucleotide collection consists of GenBank+EMBL+DDBJ+PDB+RefSeq sequences, but excludes EST, STS, GSS, WGS, TSA, patent sequences as well as phase 0, 1, and 2 HTGS sequences and sequences longer than 100Mb. The database is non-redundant. Identical sequences have been merged into one entry, while preserving the accession, GI, title and taxonomy information for each entry.
Molecule Type:mixed DNA
Update date:2025/11/24
Number of sequences:119617459
-
See details
- Query ID
- NZ_JAAQGR010000049.1 NZ_JAAQGR010000049.1
- Description
-
Clostridioides difficile strain TW12 TW12_134_length_2047_cov_30.185638, whole genome shotgun sequence
- Molecule type
- dna
- Query Length
- 2105
- Other reports
-
Distance tree of results
MSA viewer
Help
Reports are generated on using all sequences producing significant alignments. To generate reports on a subset of sequences, use the report links in the Descriptions tab while selecting specific sequences.
Filter Results
-
Sequences producing significant alignments
- Help
Subject sequences can be removed or added from within the Descriptions tab and the selections will carry through to the other tabbed views. Use the formats in Download to save data for selected sequences. Manage Columns adds and subtracts data columns from the Descriptions table. Use the click outs to see the selected results in GenBank , Graphical Sequence Viewer , BLAST Tree View , COBALT multiple sequence alignment .
-
- hover to see the title
- click to show alignments
- Alignment Scores
- < 40
- 40 - 50
- 50 - 80
- 80 - 200
- >= 200
- Help
The graphic is an overview of the database sequences aligned to the query sequence. These are represented horizontal bars colored coded by score and showing the extent of the alignment on the query sequence. Separate aligned regions on the same database sequence are connected by a thin grey line. Mousing over an alignment shows the database sequence title. Clicking an alignment displays a box with more details about the alignment and link to the sequence alignment itself in the Alignments section of the report.
- 100 sequences selected
- Help
To select sequences, go to the Descriptions tab
Distribution of the top 100 Blast Hits on 100 subject sequences
Query1400800120016002000 -
- Help
- Alignment view: Choose how to view alignments. The default "pairwise" view shows how each subject sequence aligns individually to the query sequence. The "query-anchored" view shows how all subject sequences align to the query sequence. For each view type, you can choose to show "identities" (matching residues) as letters or dots. more...
- CDS feature: Show annotated coding region and translation. more...
- Line length: Number of letters to show on one line in an alignment.
- 100 sequences selected
- Help
To select sequences, go to the Descriptions tab
Loading alignment... for sequences gi|1402399321,gi|643433981,gi|643433965,gi|643433963,gi|643433957 AlignDB=on Reading indexes 1-5MAG: Poliovirus 3 clone V8A3 polyprotein gene, partial cdsMG571846.171381Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2724 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2665 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2664 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2605 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2604 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2545 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2544 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2485 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2484 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2425 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2424 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2365 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2364 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2305 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2304 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2245 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2244 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2185 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2184 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2125 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2124 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2065 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2064 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2005 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2004 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 1945 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1944 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 1885 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1884 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1825 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1824 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1765 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1764 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1705 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1704 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1645 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1644 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1585 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1584 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1525 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1524 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1465 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1464 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1405 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1404 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1345 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1344 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1285 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1284 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1225 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1224 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1165 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1164 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1105 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1104 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1045 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1044 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 985 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 984 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 925 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 924 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 865 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 864 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 805 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 804 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 745 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 744 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 685 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 684 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 625 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 624 TGATC 620Human poliovirus 3 strain NIE1218543, complete genomeKJ170635.173791Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2830 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2770 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2710 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2650 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2590 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2530 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2529 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2470 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2469 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2410 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2409 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2350 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2349 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2290 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2289 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2230 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2229 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2170 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2169 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 2110 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 2050 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2049 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1990 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1989 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1930 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1929 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1870 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1869 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1810 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1809 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1750 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1749 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1690 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1630 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1629 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1570 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1569 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1510 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1450 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1449 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1390 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1330 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1270 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1269 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1210 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1209 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1150 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1090 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1030 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 970 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 910 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 850 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 790 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 789 TGATC 785Human poliovirus 3 strain NIE1118497, complete genomeKJ170627.173791Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2830 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2770 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2710 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2650 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2590 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2530 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2529 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2470 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2469 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2410 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2409 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2350 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2349 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2290 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2289 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2230 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2229 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2170 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2169 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 2110 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 2050 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2049 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1990 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1989 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1930 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1929 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1870 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1869 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1810 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1809 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1750 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1749 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1690 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1630 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1629 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1570 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1569 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1510 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1450 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1449 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1390 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1330 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1270 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1269 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1210 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1209 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1150 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1090 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1030 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 970 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 910 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 850 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 790 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 789 TGATC 785Human poliovirus 3 strain NIE1218546, complete genomeKJ170626.173791Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2830 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2770 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2710 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2650 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2590 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2530 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2529 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2470 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2469 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2410 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2409 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2350 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2349 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2290 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2289 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2230 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2229 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2170 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2169 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 2110 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 2050 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2049 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1990 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1989 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1930 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1929 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1870 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1869 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1810 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1809 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1750 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1749 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1690 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1630 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1629 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1570 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1569 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1510 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1450 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1449 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1390 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1330 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1270 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1269 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1210 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1209 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1150 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1090 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1030 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 970 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 910 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 850 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 790 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 789 TGATC 785Human poliovirus 3 strain NIE1218551, complete genomeKJ170623.173791Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2830 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2770 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2710 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2650 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2590 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2530 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2529 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2470 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2469 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2410 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2409 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2350 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2349 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2290 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2289 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2230 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2229 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2170 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2169 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 2110 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 2050 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2049 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1990 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1989 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1930 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1929 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1870 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1869 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1810 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1809 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1750 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1749 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1690 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1630 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1629 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1570 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1569 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1510 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1450 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1449 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1390 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1330 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1270 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1269 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1210 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1209 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1150 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1090 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1030 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 970 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 910 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 850 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 790 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 789 TGATC 785Loading alignment... for sequences gi|643433955,gi|643433953,gi|643433951,gi|643433941,gi|643433939 AlignDB=on Reading indexes 6-10Human poliovirus 3 strain NIE1218550, complete genomeKJ170622.173791Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2830 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2770 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2710 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2650 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2590 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2530 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2529 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2470 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2469 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2410 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2409 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2350 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2349 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2290 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2289 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2230 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2229 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2170 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2169 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 2110 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 2050 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2049 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1990 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1989 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1930 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1929 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1870 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1869 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1810 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1809 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1750 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1749 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1690 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1630 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1629 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1570 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1569 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1510 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1450 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1449 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1390 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1330 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1270 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1269 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1210 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1209 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1150 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1090 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1030 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 970 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 910 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 850 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 790 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 789 TGATC 785Human poliovirus 3 strain NIE1018466, complete genomeKJ170621.173791Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2830 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2770 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2710 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2650 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2590 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2530 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2529 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2470 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2469 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2410 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2409 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2350 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2349 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2290 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2289 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2230 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2229 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2170 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2169 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 2110 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 2050 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2049 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1990 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1989 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1930 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1929 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1870 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1869 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1810 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1809 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1750 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1749 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1690 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1630 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1629 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1570 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1569 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1510 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1450 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1449 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1390 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1330 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1270 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1269 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1210 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1209 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1150 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1090 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1030 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 970 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 910 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 850 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 790 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 789 TGATC 785Human poliovirus 3 strain NIE1218540, complete genomeKJ170620.173791Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2830 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2770 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2710 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2650 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2590 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2530 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2529 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2470 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2469 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2410 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2409 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2350 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2349 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2290 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2289 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2230 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2229 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2170 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2169 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 2110 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 2050 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2049 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1990 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1989 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1930 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1929 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1870 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1869 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1810 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1809 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1750 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1749 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1690 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1630 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1629 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1570 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1569 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1510 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1450 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1449 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1390 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1330 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1270 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1269 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1210 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1209 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1150 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1090 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1030 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 970 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 910 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 850 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 790 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 789 TGATC 785Human poliovirus 3 strain NIE1218545, complete genomeKJ170615.173791-
See 2 more title(s)
See all Identical Proteins(IPG) Human poliovirus 3 strain NIE1018523, complete genomeKJ170616.17379Human poliovirus 3 strain NIE1018505, complete genomeKJ170617.17379
Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2830 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2770 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2710 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2650 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2590 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2530 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2529 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2470 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2469 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2410 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2409 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2350 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2349 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2290 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2289 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2230 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2229 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2170 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2169 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 2110 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 2050 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2049 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1990 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1989 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1930 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1929 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1870 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1869 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1810 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1809 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1750 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1749 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1690 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1630 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1629 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1570 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1569 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1510 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1450 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1449 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1390 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1330 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1270 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1269 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1210 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1209 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1150 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1090 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1030 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 970 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 910 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 850 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 790 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 789 TGATC 785Human poliovirus 3 strain NIE1118496, complete genomeKJ170614.173791Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand Frame 3888 bits(2105) 0.0() 2105/2105(100%) 0/2105(0%) Plus/Minus Query 1 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2889 CATGCCCATTATTAGCGTTGGTGAAGTTGGCGGTTACCACGAAGGTGAATTCCATGTCAA 2830 Query 61 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2829 AACGAGAGTATGTGAAAAACTCCAACTTACGGCGCAACTGCACTGTATCTTTGTATGTAA 2770 Query 121 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2769 TGCGCCACATGGCAAATAGTTTCTGTGCCCGGGTGGTTGGTTGTTCATTGTCCACCTCAA 2710 Query 181 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2709 TAATAGCGACGCACGCCCCGCGTGCGAAGAATGATTCTATTGTGGACTCTGACCTGCTGC 2650 Query 241 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2649 GTCGTTGGACTACGTGGCGCGTTTGAACTGTGTCGGATGGTGCCAGAGGATTGGTGGCTC 2590 Query 301 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2589 CAGTCTCGACTGCAGTGAGTGCAGGTACCTCCTTGGAATGCGCCGGGCCACTGGCCTTAG 2530 Query 361 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2529 TATCAGGTAAGCTATCCTGTTGCTTCGGGAGTGACAAAGTTAGGGCGCCCTGTGCAACTT 2470 Query 421 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2469 CAGAAGTCAAATCTTCAATACCCTGTGGAAGCGCAGATTGTGAAATGTGAGTGGTGTCTC 2410 Query 481 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2409 GCAGCAATCGCACACTGAAATCATTACAGGCTGACACAAACCCCAGCATGCTCATACTCT 2350 Query 541 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2349 TAGGGGTGGACAGTGGCACCACAATTCTTGTTTGGTAGAACATGCTGATATATCCGCCCT 2290 Query 601 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2289 CAGTGAAACTATCTTGTGTAGTCTGTCTGTATGTCACATTACTAATCCACGGCACCACCA 2230 Query 661 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2229 TAGTACAAGATGATTGCAGGCCAAGATCCCAAATGACATGTGTGCCCAACATAGCCTCCT 2170 Query 721 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2169 TACGGCTGGTGGGGGGTTGTGCACCTGGTGGTGCATAGGCCACTAGGATTTTCCCCGTAG 2110 Query 781 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2109 CCATCATTGAACCACAGAACAGGAAGGTAAATTTCAAGGACCCGGCCCAATGAGTATAAT 2050 Query 841 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2049 AGTTCAGTACTTCCCCAAGCATGGTGTGTGACAAGCGCGGATCAAATGCTGGGGATAGTG 1990 Query 901 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1989 ACAAGCACAAAATTGGTTGCGATAGATCGGCACTGTCGCTCAGAGTAACTCTGTACATGT 1930 Query 961 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1929 CCATTGTGTTTCTCTTGGTGCTCTCCAAATTGAGAGGAATCATGGTGTCTATCTCGGCGA 1870 Query 1021 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1869 GCTCCATCATGTTTTTAACCTCACCTGGGATATCAATAGGCGGAGTGACATCAAATTCTG 1810 Query 1081 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1809 GGATTGCGCATGGTGATTGGTGGTTGTCTGACGTCAGGTACTGGTTACTACCAGGAGTGT 1750 Query 1141 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1749 TCAACACTGGTAGTCCTTGAAATTTAGGTGCAGTCACGTTGCGAAGGCCGTTGAACTCGC 1690 Query 1201 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1689 TACACATTGGGGCAATTGTCACAGTAATTGGAATTTCAACTGATGAATCTTGAGCAAAAT 1630 Query 1261 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1629 CCAGCGGTGATAAGGGCAGAATGGCAATGCCCCAGTTGTTGTGTTTAACCATTGAATCAA 1570 Query 1321 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1569 TGGCCAAAGCATTCACATATGGTAGGACAATAGTTGCGCTGTTGTTGGTCCTCAGATTAA 1510 Query 1381 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1509 TGATTTGATGTGGGTATACAAAGGCATTTCCCAGTAACACCCCACATCCCAGGAGATAAT 1450 Query 1441 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1449 CCACTGGGCAGAACTCTCTTTTTGGGGATGTTACTGCGTTATCCTTGTTGAATTGGGAGT 1390 Query 1501 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1389 AAAATTTTCCCCCTCTTTCACCTGGATTCGCATTTGCATAACTAGTGTACCTTTGCTTGT 1330 Query 1561 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1329 CACTGTCACCCGCCAGACAATACTCAGGAATCGCAAACACCCCGAGTGCACCTTGGTGAA 1270 Query 1621 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1269 ATTTGGATGCATTACACTGCACGTGCACAGTGTACCCGGATCTTCCTAGGTAGTGGTAAT 1210 Query 1681 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1209 ACATGTTTTGTCCAAACAGACCCATGTCTCTCAGTGCGTCAGGTAACTTCCACCACCAGC 1150 Query 1741 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1149 CTTTCGACTCCTTACCCCACATTACAGTGTCTAGTGTGTAGAATCTGCATGTAGCCACAT 1090 Query 1801 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1089 CTGGTTCAGTTGGTTGGTCCACCGGGTTTGCTTCGTCATCTCTAATAAACTCAGGCCAAC 1030 Query 1861 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1029 GTCCGTAAGCCACTACTGAATTTGCTGCCTCCTGTGTAGTAATAGTGGAATTGCCTAAAG 970 Query 1921 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 969 TGAGTTGCAACACTCTATCACTATACCCACACGCTTCCACATTTGGTGAATTGAGTGCTG 910 Query 1981 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 909 GAGCTGTTTTTATGAGCACGTCCTTTAGTGGCTCGGTGAATTTTGATGGATCCTGTGAGT 850 Query 2041 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 849 AATCTTGTTTGGACGCCGCATTACTTGCGGAATCTTTATAATAATTAATTGTGGTGTAGT 790 Query 2101 TGATC 2105 ||||| Sbjct 789 TGATC 785 -
Reports
- 100 sequences selected
- Help
To select sequences, go to the Descriptions tab
-
Lineage Report Organism Blast Name Score Number of Hits Description root 126 .Enterovirus viruses 124 ..Enterovirus C viruses 122 ...Poliovirus 3 viruses 3888 121 ...Poliovirus 2 viruses 3877 1 ..Human enterovirus viruses 3871 2 .synthetic construct other sequences 3877 2 -
Organism Report Description Score E value Accession Poliovirus 3 [viruses] Next Previous First 3888 0.0 MG571846 3888 0.0 KJ170635 3888 0.0 KJ170627 3888 0.0 KJ170626 3888 0.0 KJ170623 3888 0.0 KJ170622 3888 0.0 KJ170621 3888 0.0 KJ170620 3888 0.0 KJ170615 3888 0.0 KJ170616 3888 0.0 KJ170617 3888 0.0 KJ170614 3888 0.0 KJ170612 3888 0.0 KJ170604 3888 0.0 KJ170605 3888 0.0 KJ170606 3888 0.0 KJ170607 3888 0.0 KJ170608 3888 0.0 KJ170609 3888 0.0 KJ170610 3888 0.0 KJ170611 3888 0.0 KJ170595 3888 0.0 KJ170596 3888 0.0 KJ170587 3888 0.0 KJ170579 3888 0.0 KJ170580 3888 0.0 KJ170581 3888 0.0 KJ170582 3888 0.0 KJ170583 3888 0.0 KJ170584 3888 0.0 KJ170585 3888 0.0 KJ170586 3888 0.0 KJ170578 3888 0.0 AY184221 3882 0.0 MG212477 3882 0.0 MG212474 3882 0.0 MG212445 3882 0.0 PP068133 3882 0.0 OR253702 3882 0.0 OQ451883 3882 0.0 OP137281 3882 0.0 KJ170669 3882 0.0 KJ170661 3882 0.0 KJ170638 3882 0.0 KJ170636 3882 0.0 KJ170634 3882 0.0 KJ170632 3882 0.0 KJ170630 3882 0.0 KJ170625 3882 0.0 KJ170624 3882 0.0 KJ170619 3882 0.0 KJ170613 3882 0.0 KJ170603 3882 0.0 KJ170598 3882 0.0 KJ170599 3882 0.0 KJ170600 3882 0.0 KJ170601 3882 0.0 KJ170602 3882 0.0 KJ170597 3882 0.0 KJ170594 3882 0.0 KJ170591 3882 0.0 KJ170592 3882 0.0 KJ170593 3882 0.0 KJ170588 3882 0.0 KJ170589 3882 0.0 KJ170590 3882 0.0 KJ170576 3882 0.0 MN541002 3882 0.0 MN540990 3882 0.0 MN541064 3882 0.0 MN540981 3882 0.0 MN540979 3882 0.0 X00925 3877 0.0 MF541373 3877 0.0 KT946716 3877 0.0 KT946715 3877 0.0 MG212493 3877 0.0 MG212483 3877 0.0 MG212449 3877 0.0 MG212447 3877 0.0 MG212444 3877 0.0 MG212443 3877 0.0 MG212442 3877 0.0 MG212441 3877 0.0 MG212432 3877 0.0 OP137276 3877 0.0 OP137275 3877 0.0 OP137272 3877 0.0 KJ170670 3877 0.0 KJ170668 3877 0.0 KJ170664 3877 0.0 KJ170663 3877 0.0 KJ170662 3877 0.0 KJ170660 3877 0.0 KJ170658 3877 0.0 KJ170654 3877 0.0 KJ170652 3877 0.0 KJ170651 3877 0.0 KJ170642 3877 0.0 KJ170641 3877 0.0 KJ170640 3877 0.0 KJ170637 3877 0.0 KJ170633 3877 0.0 KJ170631 3877 0.0 KJ170629 3877 0.0 KJ170628 3877 0.0 KJ170618 3877 0.0 KJ170577 3877 0.0 HM537008 3871 0.0 MG451811 3871 0.0 MG451807 3871 0.0 MF678293 3871 0.0 MG212478 3871 0.0 MG212458 3871 0.0 MG212451 3871 0.0 MG212430 3871 0.0 OR208608 3871 0.0 OP137278 3871 0.0 KJ170673 3871 0.0 KJ170657 3871 0.0 KJ170656 synthetic construct [other sequences] Next Previous First 3877 0.0 MZ165620 3871 0.0 MZ165621 Poliovirus 2 [viruses] Next Previous First 3877 0.0 HM537010 Human enterovirus [viruses] Next Previous First 3871 0.0 MH933848 3871 0.0 MH933847 -
Taxonomy Report Taxonomy Number of hits Number of Organisms Description root 126 4 . Enterovirus 124 3 .. Enterovirus C 122 2 ... Poliovirus 3 121 1 ... Poliovirus 2 1 1 .. Human enterovirus 2 1 . synthetic construct 2 1