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新しい論文です！
2018年に発表したTocky技術を、7年かけて深層学習（AI）と組み合わせました。
Tockyデータの時間パターンを解析することで、免疫遺伝子のはたらきの時間動態を解明する手法を確立し、Nature Communications に論文が掲載されました。
nature.com/articles/s4146
概要図はこちら
Masahiro Ono 小野 昌弘
Masahiro Ono 小野 昌弘
4,734 posts
Masahiro Ono 小野 昌弘
@masahirono
免疫学者, 医師
Imperial College London
T細胞免疫・記憶の研究
Tocky開発者 bit.ly/31Fsngi
HP monotockylab.github.io
Youtube bit.ly/3OZHnJ5
HP monotockylab.github.io
Youtube bit.ly/3OZHnJ5Masahiro Ono 小野 昌弘’s posts
コロナはただの風邪ではない。「伝染する肺炎」と受け止めるのが的確と思う。そもそも肺炎は医学的に重大な状態。しかもコロナの肺炎は血栓ができやすい、全身状態の急速な悪化を招きやすいなど、タチが悪い。重症者で免疫系の異常な反応がみられ、この手の免疫の暴走は危険。やはりただの風邪ではない
大学生のころ、カルト宗教の背景を持った女性に、下宿に入り込まれました。
宗教２世で、その宗教からは離脱したと話す女性でしたが、その人が、私が知らない間に、私の下宿に入り込んであらゆるものを漁り、私の通帳の内容を調べ、人間関係と家族・親戚構成を詳細に調べていたことを、その後知ります
人選に目を疑ってしまいました。感染症の専門家も疫学の専門家もなしに第２波を制御できると思ったら甘いと思う。近縁・関連領域すらなく、医学系でも一番遠い専門の人たちと工学とは..第１波の経験者が全ていても足りないというのに、なんという傲慢。スパコンもAIも専門家の代わりにはならない
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西村やすとし NISHIMURA Yasutoshi
@nishy03
第二波に備えAI、世界一のスパコン #富岳 を最大限活用し、感染防止策の効果分析を進める。政策研究大学院大学の #黒川清 名誉教授を委員長、#山中伸弥 教授にも参加いただき、アドバイザリーボードを設置。8割接触削減の #SIRモデル などの効果分析を行い、より効果的な感染防止策の検討を加速。
本当の状況は少し違いますので説明します
英国は病院の状況を鑑みて「生活規制必要なし」と判断していますが、英国の公的医療NHSは日常的に深刻に崩壊しているので日本の参考にはなりません。
英国のNHSでは基本は一般医（GP）に診てもらうのみです。専門医は紹介になりますが、異常な待ち時間です。
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佐竹実（日本経済新聞／Nikkei）
@SatakeMinoru
ロンドンはほとんどの人がノーマスクです。イギリスが新型コロナを風邪と扱うようになってから半年近くが経ち、コロナ禍は過去のもになっています
一方でいつまでもマスクが外せない日本
日英の違いの一つは、子どもの成長や暮らしを優先しているかどうかだと思います
↓ nikkei.com/article/DGXZQO
コロナの重症化はウイルスの違いではなく免疫反応の違いによる。ウイルスの遺伝配列は自然に変異するものだが、病原性が違う「型」は現時点でみつかっていない。一方で、免疫の過剰な反応がコロナを重症化させることは確実。
「ウイルスの凶暴化」「東京型」といった話は根拠がなく、信頼すべきでない
コロナについて、PCRであれ抗体検査であれ、質の悪い検査で「大丈夫だった」という偽の安心を得ると、あなたの行動が不用心なものに変わる。それはあなた自身と家族や友人の健康・生命を危機に陥れかねない。
つまり、正しい不安は人を助け命を守り得るし、質の悪い検査による偽の安心は人を殺しえる。
日本が素晴らしいと思うあまり不思議な返信して来られる方々へ：もうコロナで時代が変わったので夜郎自大はやめましょう。対コロナ戦は長期戦で第１波だけの問題ではなく、今後２ー３年をどう乗り切るかが課題です。他国の対策・結果を分析して学び自国に活用すべく必死で考えるべき。英国も必死ですよ
• アンジェスは100億円規模の血税を使ったのですから、国民に説明責任があると思います
• 挑戦の資格があるのは、世界に通用する実績があって、目標達成できる現実な計画がたてられる有能なチーム
• 従来株に対するワクチンが作れないというレベルの技術ならば、変異株に対するワクチンは作れません
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吉村洋文（大阪府知事）
@hiroyoshimura
吉村知事 大阪発のコロナワクチン開発断念や治療薬承認見送りに「失敗、挑戦認める社会にならないと」
→僕も発信しました。申し訳ないです。ただ、挑戦を認める社会は失敗も認める社会。失敗してもまた次の挑戦を認める社会。何もせずに批判だけする社会では後進国になる。 news.yahoo.co.jp/articles/0a756
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その女性は、私の知らないところで、私の友人関係・家族関係に浸透して、さまざまな細かい工作を行い、いつの間にか私が思っていた世界と、周りが自分を見る世界が全く違うものに変えられてしまいました。カルトの本質は、教義の内容より、洗脳と詐欺の手法にあると思わされた事件でした。
９２年、高校の国語の先生が高校最後の授業で、統一教会とオウム真理教につき詳説してくれた。この２つの宗教の歴史からはじまり、彼らがどのように大学のサークルを利用して勧誘しているかを教えてくれた。この最後の授業のおかげで京大の同級生をオウムのヨガサークルから救うことができた経験がある
１年でコロナ流行が終息すると思うのは甘すぎる。英国は現在の第一次封鎖が６ヶ月間になる可能性が予告されており、その後も２年以上にわたり感染爆発の波が襲う可能性に備えている。こうして流行の波が世界中で来年以降まで遷延する可能性が高くなっているというのに、何を寝ぼけた事を言っているのか x.com/tbsnewsdig/sta
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コロナ「変異種」という単語が頻用されているが、新しい「種」ではないので間違った用語だし、語感からも誤解を招く。英国型などで今問題のウイルスは遺伝子配列が少々変異したものに過ぎず、依然として同じ新型コロナウイルスSARS-CoV-2であることには変わらないので、変異株が正しい用語。
ただの感想ですが、岩田先生のビデオは国際的に通用する論理で話をしていると思う。高山先生の記事は、国内向けの論理ばかりで疑問に思ったーこれはたとえば、英語に訳したら意味不明な点が明確になるかなと思う。あと、後者は前者の信用を落とすための余計な文章が多くて、ちょっと残念に思った。
デルタが「死滅」「自壊」して第五波が収束したという話が流布しているが、少なくともこの報道などの中の話は（巧みに専門用語がいれこまれているが）信頼に足らず、今後の日本社会にとって有害な言説であると強く思うがゆえに注意を喚起したい。このため少し考えを書いておく（続）
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報道ステーション＋サタステ
@hst_tvasahi
【#第5波 収束の裏で何が？】
国立遺伝学研究所と新潟大学の分析では、
#デルタ株 の感染が広がった結果、デルタ株に”ある異変”が起きウイルス自体が“死滅”していった可能性があるといいます
▼一体どういうことなのか。マンガでお伝えします
#高島彩 #ニュースのあや
@Station_sat #サタステ
The media could not be played.
抗体検査はこういう使い方をしてはいけない悪い見本みたいな話ですね...
大阪市長の計画は、本当は感染しているが抗体が陰性の人たちに間違ったお墨付きをあげて、その人たちが無防備に旅行するのを促進して、感染が観光地各地に広がる可能性を押し上げます...
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日本経済新聞 電子版（日経電子版）
@nikkei
「GoTo」利用の希望者、抗体検査へ 大阪市長方針 nikkei.com/article/DGXMZO
英国は「マスクを外してコロナ禍が終わった」国という理解が広まっていますが、本当の状況はかなり異なります。本記事では、英国におけるコロナと医療の全般的な状況を説明します。
news.yahoo.co.jp/byline/onomasa
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少し誤解が広まっていますが、英国において、健康問題のため働けない若い人が急増しているという問題の中心は、コロナ後遺症ではなくて、日常的な医療崩壊のため、あらゆる慢性の病気がまともに診てもらえず治療してもらえない状態になっているところです。
日本はこれまで予想より流行制御がうまくいっているが理由が霧の中。理由は日本の衛生・自粛が効率良いからか、それ以外に科学的理由があるのか、多面的に分析するのが重要と思う。何がよかったか分かれば今後の日本および世界を救う。逆にわからないと、行き当たりばったり政策が続き社会の疲弊が進む
これはどう考えても政府が予算をつけて「無給医」をきちんと雇用し給料だすべき。大学の予算は削られて余分が存在しないのだから、責任は政府にある。無給で働かせさらに前線に立たせるとはあまりに不公正、医療崩壊につながりかねない
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NHKニュース
@nhk_news
「無給医」も新型コロナ患者治療の前線に 医師不足のため #nhk_news www3.nhk.or.jp/news/html/2020
わからない病気ってこんなものですから、楽観もよくないですが、極度の悲観も必要ないです
実は、深刻な慢性病や癌の患者さんがたは、前からこういう不確実さと厳しさを抱えて、でも将来に希望をもちつつ現在の人生を精一杯生きてられます。コロナの時代は、彼らに健康な人々が学ぶべきと思っています t.co/WK4vaBVIqs
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カルトに汚染された政治家が牛耳っている政党に、コロナやワクチン・医療への科学的な理解と対応を期待できるわけがなかったですね。日本のこれまでの長い迷走の理由が腑に落ちました。
科学の基本は、願望や宗教的目的等に影響されずに、データと正しい知識に裏付けされた思考で判断することですから
南アは（各国から入国禁止にされ経済に打撃であることを知りつつ）オミクロンの情報を遅延なく公開した。これは世界にとって大きな貢献。このような国が損失を一方的に被るのは公平でないのみならず将来に禍根を残す。ここで最も被害を被る貧困層・医療機関を助ける国際的な連帯メカニズムが必要
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Tulio de Oliveira
@Tuliodna
On the non discrimination & support for Africa financially on my tweets I do mention that we do NOT need extra funding to our science but to support poor people & health care system as they are the ones that suffer the most when loose jobs from travel bans or have to isolate!
情けない記事。早く開発できたには理由がある：
•がん・他のウイルス感染症のため、設計に柔軟性があり開発が早い新しいワクチン技術が既に完成していた
•英政府などワクチン成功がわかる前から購入契約をし、製薬企業は失敗を心配せずに開発できた
•効果が大規模な臨床試験で想定以上の結果だった
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朝日新聞国際報道部
@asahi_kokusai
急造ワクチン、受けるか待つか 接種開始の国で悩む邦人：朝日新聞デジタル asahi.com/articles/ASNDL #新型コロナウイルス
いま手に入る簡易抗体検査キットは欠陥が多い（私自身も使う気がしないものです）ので、多数購入しても、お金と努力の無駄と思います。現在やるべきは、そのお金を本当の実力がある生化学・免疫学の大学の研究室に渡し、臨床的に意味があり信頼できる抗体検査を開発させることです。急がば回れ、です
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須藤元気
@genki_sudo
Replying to @genki_sudo
皆さんたくさんのご意見ありがとうございます！先ほど蓮舫副代表に簡易抗体検査キットについてご相談させて頂きました。政府・与野党連絡協議会でお話してもらう事になりました。いろいろ予算取れるよう引き継ぎ頑張ります！
専門家会議を廃止したとき、みなが懸念していたことが、そのまま現実になっているようですね。官邸が積極的に専門家の知を封じ、情報を曖昧にし、目先の利益のために、真面目な国民の足を引っ張り、感染爆発に引きずりこむ構図のようにみえますね。
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Yahoo!ニュース
@YahooNewsTopics
【分科会 官邸抵抗で指標示せず】
yahoo.jp/vhiUrg
政府の新型コロナ感染症対策分科会は、対策強化の予兆を見極めるための客観的指標を示せなかった。コロナ対策が経済の足を引っ張ることを懸念する首相官邸が抵抗し、事前の調整がつかなかったため。
ジョンソン首相「季節性インフルエンザに比べる人もいるけれど、それは正しくない。免疫がないのだから、この病気はもっと危険だ」
＊的確簡潔に本質を説明。致死率が問題なのではなくて、誰も免疫を持っていない病気が急速に広がること（社会での感染動態が違うこと）が問題
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コロナ以外の医療を止めた結果、手術はもちろん、専門医に受診することすら待機リストが異常な長さになり、緊急性を要するがん患者でも半年待ちの人が続出、慢性疾患だと１年半待ちの人すらいる状態です。このため労働人口のうち３０万人の人が慢性的な疾病のため働けない事態にあると分析されています
「日本人は特殊な遺伝的あるいは環境の因子のおかげでコロナから守られている」という感覚は広くみられて、この２年間の言説、さらには科学研究を左右してきたと思う。しかし、そもそも日本のコロナ流行と被害がどのようなものであったかを見直してみると違う様相が見えてくると思うので、整理してみる
科学者があやふやな説で経済のための楽観論に与して迎合するのは大きな問題と思う
コロナは当面いなくならないし、日本人の免疫が特に強いことはないし、若者でも重症化しえる
序盤の制御ができたから今後もできるとは限らない。なぜ制御できたか・できなかったか、分析し学び改善し続けるるほかない
インドでコロナ流行が大爆発し人道危機に至った背景に、インドの政策担当者・メディア・科学者が誤った科学と不正確な統計データに基づいて、インドはもう集団免疫を獲得している、子供のころのワクチンで守られている、「インド人は特別だ」という幻想を広めていたという...
オリンピック延期の根回しをやっているせいで、重大な感染制御のための政策決定が遅れ、無駄に時間を失ったことにより失う命の数は、相当に大きいかもしれません。この人命の損失は事後で科学的に評価・計算できることなので、曖昧にすませず、徹底的に検証しないといけないです。
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岩田健太郎 K Iwata
@georgebest1969
出た、空気を醸造して「みんなそれでいいよな、仕方ないよな」となってからゴーサインを出すやり方オリンピック延期もこれでした。ただしこの方法で出た遅れの損失は大きい。 x.com/YahooNewsTopic…
仮にこれまでの専門家会議の人たちに意見を求める形になっても、このような無関係の素人が「専門家」として、本当の専門家の上に立つことならば、その弊害はとてつもなく大きいと思う。頓珍漢な意見が科学的アドバイスとごっちゃにされれば、機動性も効果も失われる。現政権は科学を捨てたのかな
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Masahiro Ono 小野 昌弘
@masahirono
人選に目を疑ってしまいました。感染症の専門家も疫学の専門家もなしに第２波を制御できると思ったら甘いと思う。近縁・関連領域すらなく、医学系でも一番遠い専門の人たちと工学とは..第１波の経験者が全ていても足りないというのに、なんという傲慢。スパコンもAIも専門家の代わりにはならない x.com/nishy03/status…
これは山中先生がご存知ないだけで、感染症疫学・数理疫学のひとたちなどみなさんエビデンスに基づいて過去のデータと一定の予測の範囲内で議論していますよ。今回の新型コロナウイルスについてのデータが少ないからといって、すべての学問をかなぐり捨てて素人竹槍戦術を勧める様子にはがっかりです。
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Mi2
@mi2_yes
政府の自粛要請について、山中伸弥教授「今よく言われるのは『エビデンスはあるんですか』と、これはエビデンスを待っていたらいつまでも対策はできない。人類初経験エビデンス何かどこにもない。その間何もしなかったら手遅れになる」
この前、科学的根拠は？とか連呼してた蓮舫とかいう議員がいたな x.com/mi2_yes/status
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これはつまり多くの人のなかでワクチンの効果が減弱してくる時期に日本でも流行の再燃が起きる可能性があるという意味でもある。ワクチン接種後5-6ヶ月後からワクチンによる防御の低下がめだってくることは事実として重要。「死滅・自壊説」のような根拠薄弱の言説は社会に有害であると考える（了）
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パンデミック以前から保守党政権下で医療費削減が進み、専門医に診てもらうのに半年以上待つのが普通になっていました。
そして2020年のコロナ大流行中、英国はコロナ治療に注力するため、手術室の機能を救急に使い、コロナ以外の医療を基本全て停止、とくに、がん治療の手術を止めてしまいます。
オミクロンが「自然のワクチン」にならない理由
news.yahoo.co.jp/byline/onomasa
オミクロンが「弱毒株」であるゆえ「自然のワクチンになり」パンデミックの出口に至るという楽観論が世界で広まっており、日本にも到達したようです。科学的には根拠のない話ですが、よくみうけられる疑問を検討してみます。
「日本人は『ファクターX』があるから大丈夫」「BCGで守られているから大丈夫」「コロナの交差免疫があるから大丈夫」...といった科学的根拠のない言説を広めることがいかに危険であったかということを改めて認識する
Quote
Masahiro Ono 小野 昌弘
@masahirono
インドでコロナ流行が大爆発し人道危機に至った背景に、インドの政策担当者・メディア・科学者が誤った科学と不正確な統計データに基づいて、インドはもう集団免疫を獲得している、子供のころのワクチンで守られている、「インド人は特別だ」という幻想を広めていたという...
theguardian.com/world/2021/apr
英のコロナ流行データ分析で、第１波のときあと１週間はやくロックダウンしておけば死者は半減していたとする推定
感染者数が指数関数的に増加しているときに早くロックダウンをはじめたほうが、ロックダウンを長期におこなうよりも死亡数を減らす上ではるかに効果的であると
imperial.ac.uk/mrc-global-inf
本格的な第２波の可能性が高くなっている現状でGo To観光キャンペーンを進めると、観光地がホットスポットになる可能性が高くなるだけではと思う。首都圏だけでも大変なのに全国で各地で感染が同時進行したら対策はますます困難だし、観光地も感染蔓延させるとより強い自粛を余儀なくされ逆効果では。
英国健康相「一部の国が科学に十分従っていないが批判しない、それぞれできる限りのところでベストをしているのだから」
＊これは意訳すると、科学に従わないでようやるね、まあレベルが低いのだからしゃあないね、頑張って。我々は当然科学に従っていくよ、という英国流の嫌味
南アの新しい変異株B1.1.529
認知されたのがこの１週間、データは超早期で不確かだが懸念材料多い
•南ア１地方から急速に拡大；絶対数少ないが急激に増加傾向
•スパイクの変異多数〜免疫逃避・感染力増強の可能性
•抑え込められ拡大しないかもしれないが、するかもしれない。金曜日にWHOが緊急会議
Quote
John Burn-Murdoch
@jburnmurdoch
Five quick tweets on the new variant B.1.1.529
Caveat first: data here is *very* preliminary, so everything could change. Nonetheless, better safe than sorry.
1) Based on the data we have, this variant is out-competing others *far* faster than Beta and even Delta did 
新規感染者数は、日本が一貫して減少していたイタリアを超え、ドイツを追い抜きつつあり、英国に迫る（英国はまた微妙に増加している...）
日本の死亡者数はまだ低いが、死亡者数増加は感染者数増加に遅れる（英国は死亡者数も下がらなくなってきたか...）
ig.ft.com/coronavirus-ch
この話は結構がっくり。今の政権が科学的対応能力を欠いているのは知っていたが、緊急事態だから内閣が無能でも周囲が助けて対応すべき時期と思った。しかし政権はろくに対策できないどころか、緊急事態下に不要不急の検察官の定年延長？？ここまでやる気がないなら政権自体がコロナ政策の邪魔ですよ
Quote
Masahiro Ono 小野 昌弘
@masahirono
コロナで日本の健康・社会・経済が危機だというのに、内閣が検察官の定年延長がしたくて今まさに法律通そうとしている？？ は？？ この内閣まともにコロナ対策もできていないのに？？ 火事場泥棒？？
ツイートの日付を見直してしまいましたが、やっぱり今起きていることなのですね.. x.com/CDP2017/status…
コロナに弱い高齢者vs強い若者という単純な二項対立の図式で話が進みがちだが、実際には、若者・子供でも稀な疾患ゆえに、循環器疾患や糖尿病がある、免疫不全である、自己免疫で免疫抑制剤を投与中、がん治療中など、感染を心配している人はたくさんいる。彼らの存在を忘れずに対策してほしいと思う