ISOイメージとIMG+cueの違い

ＣＤのバックアップを取ろうとしています。
イメージファイルを作り出せるソフトを二つ持っていて、一つはRoxio、もうひとつはCD Manipulatorです。OSはＸＰです。
Roxioの方でイメージファイルを作ると拡張子ISOのファイルが１つのみ、CD Manipulatorの方で作ると拡張子IMG+cueなどが作成されます。
どちらの方法でイメージファイルを作っても、できるファイルに差はないと思っていたのですが、できたファイルの大きさを比較してみると、サイズが異なっていて、ファイル合計ではCD Manipulatorで作った方が若干大きくなっています（イメージファイル単独では4ＭＢ大きいだけですが）。

二つの形式の差は何なのでしょう？どちらでバックアップを取っておいた方がいいのでしょうか？
私としてはファイルが一つで済むＩＳＯの方がいいのですが・・・。
アドバイスを頂きたいと思います。