ＦＣ２動画をめぐっては、これまで全国の警察機関が一斉摘発を行ってきたが、動画投稿者らの立件にとどまっており、運営者側の強制捜査に乗り出すのは初めて。

　ＦＣ２は米国の法人が運営しているとされ、実態が明らかになっていなかったが、捜査関係者によると一連の事件の捜査の中で、大阪市北区中之島のダイビルに本社があるホームページシステム社が実質的に運営している可能性が高まったという。

法人登記によると、同社は前身である有限会社が平成１４年に設立され、２０年に株式会社化。資本金は１億円で、インターネットを利用した情報提供サービスやサーバーの設置・管理などを行っているとされる。

捜査関係者によると、同社の社長ら数名は、今年６月、ＦＣ２のライブ配信サービスで、大阪市北区豊崎の自称ライブチャット配信業の男（３１）らが、性行為の映像をライブ配信するのは手助けした疑いが持たれている。

　京都府警は６月、公然わいせつ容疑でこの男を現行犯逮捕。一方、９月２５日には、警視庁などが人気ドラマやバラエティー番組を無断で投稿したとして、著作権法違反容疑で、大阪市鶴見区の３０代の無職男ら４人を逮捕、１２人を書類送検するなど、一斉摘発に乗り出している。

本部がアメリカにあるとしているため、ブログやサイトには国内法が及ばず、そのため不適切な記述の削除要請が難しかった。 しかし、2012年に民事訴訟法が改正され、日本国内で事業を展開している場合、会社が国外にあっても訴訟が可能となり、2013年にはブログ投稿者の情報開示命令が出ている。 FC2の利用者は1500万人を超えるとみられ、本社やサーバーが米国にあり法的な手段を取るのが難しく、法律に違反する投稿、権利を侵害する投稿が放置されるケースがみられると報道されている。 ネット業界の一部には“無法地帯”との呼び名で呼ばれてもいる

2013年
6月 - アニメ番組の違法アップロードによる逮捕[17]。
7月 - アフィリエイト目的で映画の違法アップロードを行い逮捕（懲役1年6月、執行猶予3年、罰金50万円）
8月 - 映画の違法アップロードに有罪判決（懲役1年6月、執行猶予 4年、罰金50万円）
10月 - 映画の違法アップロードによる逮捕（5人目、後に懲役1年6月、執行猶予3年、罰金50万円）
11月 - NHKのTV番組「あまちゃん」の不正公開により逮捕[22][リンク切れ]。

一般社団法人コンピュータソフトウェア著作権協会 (ACCS)
主に著作権侵害によるFC2ユーザの逮捕でFC2関連では国内の映像ソフトやTVアニメ作品の不正アップロードを摘発。

日本国際映画著作権協会 (JIMCA)
主に海外映画会社5社の作品不正アップロード及び海賊版を摘発。著作権侵害のFC2ユーザの摘発件数ではでは最多。


一般社団法人本映像ソフト協会 (JVA)
6月の協会会報で「無許諾アップロード事件化に係わる各警察からの問い合わせや鑑定の依頼は増加傾向にあることから、サイバースペースにおける取締りの範囲として、FC2動画が「ポストP2P」候補の１つとなる可能性がある。」と言及

AT-X (CS放送局)
2014年9月にACCSがFC2動画への違法動画投稿者を検挙した際の告訴者。

2014年9月25日警視庁と大阪府警などの3府県警と合同で全国16人のFC2ユーザを一斉摘発が行われた。