コナンは、「殺害予告の犯人を捜してほしい」と依頼を受けた小五郎と共に廃研究所を訪れる。そこには依頼人である不動産屋社長の東東一郎、秘書の河西治彦、事務員の末松末子が集まっていた。容疑者の山南弁吉、北尾充、弔加奈も呼び出され、小五郎が調査報告と事件の推理を始めるが……。不自然な点の多い事件の裏には、いったい何が潜んでいるのか? 密室の廃研究所で、“眠りの小五郎”が新たな事件を呼び寄せる!?