17年前に発生した棋士・羽田浩司の殺害事件を調べていたコナンは、似たような事件に遭遇。沖矢と共に事件の捜査を始める。犯人が凶器を持ち込む隙の無い事件現場。コナンと沖矢には犯人の目星がついていたが、殺害に使った凶器が分からず……。甘い匂いのする奇妙な遺体。犯人はどのように凶器を持ち込んだのか? 割られたコップと握りしめられたハサミ。事件現場に残されたメッセージが、17年前の未解決事件に繋がる!