最終回の終盤は、すべていままで残されていた謎や問題を解決するストーリー展開になっていました。 橘未来の脳腫瘍の手術をしたことは、問題が解決した、ということを示すシーンのひとつです。 それは「仁の心の問題」です。 仁は、現代にいたころの恋人・友永未来を、仁自身の手術の失敗により植物人間にしてしまいました。（前のシリーズの初回） そのせいで、現代の仁は医者としての自信をなくし心に大きな傷を受けて、難しい患者や困難な手術を担当することを避けて毎日を過ごしていました。 しかし、江戸にタイムスリップし、様々な経験と人との出会いがあり、心の傷は癒えて医者としても人間としても大きく成長したのです。 江戸から現代に戻り、歴史が変わった後、「友永未来」の今の姿である「橘未来」が、同じ病状で担ぎ込まれてきましたが、何も恐れずに、仁は自信をもって「俺に執刀させてくれ！」と言いました。 以前のように、困難な手術を避けるのではなく、自分から進んで二度目の「未来」の手術をしたことは、仁が完全に立ち直り、以前の未来の手術の失敗による心の問題が解決していることを表しています。 現代に戻った仁は、江戸での経験はいつかすべて夢のように忘れてしまうかもしれないけれど、自分がいろいろな人に助けられて今のここにいるのだということは決して忘れない、と強く決意しています。 江戸の人々のことを忘れず、自信を持ち一人の医者として現代で生きていこう、と心に誓った仁は、「橘未来」の手術を絶対に成功させるんだろうな・・・という余韻を残した終わり方だったと思います。 設定はとても良いと思いますし、感動するラストでしたが、たしかに質問者様の感じた通り、ちょっとわかりにくいシーンだったと思います。 質問者様同様、あれはどういう意味だろう？・・・と疑問に思っている人は多いのではないかと思います。