米花町の古民家に波賀昭人、波賀あかり夫婦が引っ越してくる。夫婦と意気投合したコナンたち少年探偵団は、家のDIYを手伝うことに。しかし、夫婦は脆くなっていた壁に穴を空けてしまい、そこから白骨遺体が出てきて……!?　 昭人が勝手に購入した家が事故物件だったことで、夫婦は険悪なムードになってしまう。コナンたちは二人のため、事件の捜査を始めるが……。夫婦が購入した憧れの古民家には、どんな曰くがあるのか？

【期間限定 毎日１話配信】 トークイベントに参加予定だった俳優の猪越が密室状態の楽屋で何者かに殺害される。元支配人の冷泉が容疑者として浮上するが、冷泉が自供したのはオーナーの順子の殺害だった。2つの事件が起きたのはほぼ同時刻。目暮警部は猪越を殺害した犯人は別にいると考える。コナンはトリックに使った道具に気付き、犯人を見破るが…

【期間限定 毎日１話配信】 小五郎はHISHIDAホールのリニューアルを記念して講演をやる事になる。当日、小五郎の楽屋に警備会社社長の月野木、俳優の猪越たちが続々とあいさつに来る。この後、元支配人の冷泉とホールのオーナーの菱田順子が揉めるトラブルが発生。そして講演20分前、楽屋で殺害された猪越の遺体が発見される。

【期間限定 毎日１話配信】 恨みを持つ男3人に拉致された妃英理。小五郎、蘭、コナンは英理がいる場所を探すため、事務所から1キロ先の東都タワーが見える増上寺にやってくる。コナンはスマホと鐘の音を利用し、英理がいる場所を分禄町と須単町に絞り込む。英理は自分のメッセージが男たちに筒抜けと知り、暗号のようなメッセージを蘭に送る。

【期間限定 毎日１話配信】 蘭のスマホに妃英理からメッセージアプリで連絡がくる。内容は「悪い奴らに捕まっている」というものだった。2時間前、英理は男3人組に拉致されて廃ビルに連れていかれる。英理は男の1人からスマホを奪って逃げ、ロッカーの中から蘭に助けを求めたのだ。コナンたちは英理を探し出そうとするが…。

【期間限定 毎日１話配信】 実夏、初村、小暮は凶器や毒物を所持しておらず、目暮たちは凶器や毒物を見つけるため、店内をもう一度調べ直す事に。コナンはふと天井を見上げて何かに気付く。そして小五郎の靴底にはガムのような事件の証拠品が付いていた。コナンはこの証拠品を足がかかりに犯人が薄田を殺害したトリックを見破って…。

【期間限定 毎日１話配信】 小五郎はバーテンダーの柚嬉から仕事中にポンという音がして、その直後に柚子の香りが漂うという奇妙な謎を解いて欲しいと依頼される。そして客の薄田が首を刺され窒息死する事件が発生。疑惑の目は会社の部下の実夏、初村、小暮に向けられる。コナンは3人が薄田の誕生日プレゼントとして持ってきた所持品に注目して…。

【期間限定 毎日１話配信】 夫の健彦、ストーカーの成治、その母親の緑という容疑者３人の話を聞いた後、コナンたちは部屋に戻って就寝。コナンは小五郎の寝言を聞き、犯人がベッドを１人で移動させた方法に気付く。翌朝、コナンは真剣に推理を巡らせる小五郎の姿を見て、小五郎に華を持たせる事に。小五郎本人による解決ショーが始まるのだが…。