研修先は、基本的に大学の系列に関係なく選択できます。 ただ、研修終了後にその病院に勤められるかどうかは別の話だと 思います。 他大学は知りませんが、私の出身校（国立医学部）と、私の都道府県の 他の大学医学部に関しては、研修前にほぼ何科に入るかを決めていて、 研修が終了した後は、その科（その大学）の医員として働いています。 質問者さんの志望する大学でもそのようになっているのなら、 やはり、働きたい病院を関連病院として持っている大学に進むのが 近道だと思います。 もちろん、出身大学以外の大学の科に就職する事も可能なので、 絶対にその大学へ入らなければ行けないわけではないです。 大学の関連病院であっても、希望の病院に勤められるわけではないし、 もしその病院に勤める事が出来ても、若いうちは1年くらいごとに異動があります。 あと、病院によっては、大学と関係なく個別に就職できる場合もあります。 これだと、異動がないので、ずっと同じ病院に勤める事ができます。 ただし、同じ科の上の先生が全て他大学だと、働きにくい場合もあります。