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論文・記事紹介：CRISPR生物学・技術開発・応用 (ゲノム工学, エピゲノム工学, 代謝工学/遺伝子治療, 分子診断/進化, がん, 免疫, 老化, 育種 - 結果的に生物が関わる全分野)； タンパク質工学；情報資源・生物資源；新型コロナウイルスの起源・ワクチン・後遺症；研究公正

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　xCas9は、Streptococcus pyogenes Cas9（SpCas9）から誘導され、SpCas9よりもPAMの制限が緩和されたCRISPRエフェクターである [＊]。中国の研究チームは今回、xCas9が昆虫のゲノム編集に有用なことを実証した。大発生することで世界的な害虫と化すトノサマバッタ （Locusta …
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　鹿児島大学を主とする研究チームは先行研究 [＊] において、AAV2/WJ11-Cas9の抗HBV効果をin vitroおよびヒト化キメラマウス肝臓で確認したが、今回、その有効性を免疫不全動物モデルで確認した。　これまで、HBVの自然感染動物モデルとしてマウスやチンパンジーが用いられ …
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[注] CRISPRa：dCas9をベースとする人工の転写活性化因子　EGFRチロシンキナーゼ阻害剤（EGFR-TKI）は、上皮成長因子受容体（EGFR）変異を有する非小細胞肺癌（NSCLC）の治療において、臨床的に大きな成功を収めてきた。しかし、複数のシグナル伝達経路の活性化、変異、欠失 …
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　明治大学とNTTの研究チームが、日本のナショナルバイオリソースプロジェクト (NBRP)の大腸菌全遺伝子変異株コレクション (KEIOコレクション) と大腸菌遺伝子クローンコレクション (ASKAクローン) 微生物変異株サイブラリーを活用して、壌中での大腸菌の長期生存率に及ぼす …
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　CRISPR-Casシステムの中で、CRISPR-Cas12aやCRISPR-Cas13aは、その「トランス開裂 (コラテラル活性）」の特徴ゆえに優れたシグナル増幅因子として、様々なCRISPR Dx（CRISPRシステムをベースとする分子の検出・診断）ツールの構築に広く利用されている。一方で、そのコラテ …
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[注] RFK Jr. (Robert F. Kennedy Jr.)2025-02-28 RFK Jr 保健福祉省長官は、26日(水曜日)のホワイトハウスでの閣議の後の記者との質疑応答ではテキサス州での子供一人の死亡を伴うはしかの発生は"not unusual"とやり過ごしたが、28日 (金曜日) になって、「はしかのアウト …
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[注] TIGR-Tas: Tandem Interspaced Guide RNA (TIGR) array and a TIGR-associated (Tas) protein　RNAにガイドされる機能性システムは、多様な生物学的機能をプログラム可能にする驚くべき汎用性を備えている。これまでにそうした機能システムを発見してきたFeng Zhangが率 …
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[注] GDF15（Growth/differentiation factor 15 / 成長分化因子15）　免疫療法の臨床的成功は目覚しいが、膠芽腫（GBM）における治療効果はまだ限定的である。GBM免疫の重要な制御因子を同定するために、我々は、すべての疾患関連免疫遺伝子に対応するマウスシングルガイドRN …
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[注] エムポックスウイルス（サル痘ウイルス/monkeypox virus, MPXV）　近年の世界的なMPXVの流行は、特に資源に乏しい環境において、迅速かつ正確な診断ソリューションの緊急の必要性を浮き彫りにしている。北京を拠点にする研究チームが今回、MPXVをマイクロ流体で検出する …
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[注] EGA：エリート選択アルゴリズムEGA (Elitist Genetic Algorithm ) ；グラフィカルアブストラクト参照　　複数のゲノム部位を同時に効率よく編集できる多重化CRISPRシステムは、複雑な遺伝子改変のための強力なツールである。しかし、効果的な多重化ガイドRNA（gRNA）ア …
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　CRISPR/Casシステムと統合されたペーパーベースの分析装置（paper-based analytical devices: PADs）は、簡便性、手頃な価格、携帯性を提供するポイントオブケア疾患診断のための革新的なツールとして登場した。本総説では、ペーパーベースのCRISPR/Cas診断プラットフォー …
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　ドキソルビシン（Doxorubicin: DOX）は、様々ながんに対する最も効果的な化学療法薬の一つである。しかし、DOXはしばしばDOX誘発性心筋症（DIC）と呼ばれ心毒性を引き起こし、これに対する有効な治療法は限られている。京都府立医科大学の研究チームが今回、DICの治療標的 …
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[注] 出典のプレスリリースへのリンクを2025-02-28 11:57 am JSTに追記　生物学をプログラム可能にするためのAI基盤モデルを構築しているLatent Labs社は、2025年2月13日、総額5,000万ドルの資金を調達し、ステルス状態から脱却した。 　同社は、Google DeepMindのタンパク質 …
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　CRISPR/Cas9システムを用いた遺伝子治療は、がんの発生、発症、進行、転移といった問題に根本的に対処することができる。しかしながら、ターゲティングと有効性の欠如が、遺伝子治療の臨床応用を妨げている。湖北大学の研究チームが今回、PD-L1標的CRISPR/Cas9システムの送 …
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　ベクターは良い意味でも、時には悪い意味でもサプライズを与えてくれる。ウイルスを改変したこれらのツールは、生命科学の研究室で広く使われている。ベクターはDNA断片、遺伝子、あるいはCRISPRの場合はガイドRNAやCas酵素のような構成要素を細胞に運び込む。ベクターは植 …
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　CRISPRを用いたRNA検出法の多くは、感度向上のために増幅と組み合わせており、エアロゾル汚染、煩雑な操作、増幅バイアスなどの欠点がある。上記の問題点を解決するために、南方医科大学の研究チームは、液滴マイクロ流体工学とCRISPR/Cas13aに基づき、ポリメラーゼ連鎖反 …
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　調節DNA中の一塩基変異（SNV）は、遺伝性がんリスクと関連している。ヒト悪性腫瘍の90％以上を占める13の新生物に関連する4,041SNVの超並列レポーターアッセイ（Massively parallel reporter assays: MPRA）を、適切なヒト初代細胞で実施し、クロマチンアクセシビリティ、D …
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　AccurEdit Therapeutics社のプレスリリースによれば、同社のヘテロ接合性家族性高コレステロール血症に対するin vivo CRISPR-Cas療法であるART002が、臨床試験において90％以上のPCSK9ノックダウンと最大70％のLDL-C低下を達成し、脂質ナノ粒子送達を用いた単回投与により …
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[注] ファイロダイナミクス (phylodynamics) 　生物の単一細胞の系統関係を解析することは、発生を促す基本的な細胞動態を理解する上で極めて重要である。CRISPR技術をベースとする動的細胞系譜追跡 [dynamic lineage tracing:Development, 2019] は、ゲノム編集とシーケン …
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[注] TAD (Topologically Associating Domain)　エンハンサーやプロモーターなどのシス制御エレメント（CRE）は、遺伝子発現の基本的な制御因子である。MYC遺伝子座は、複数のCREによって駆動される多様な制御機構を、さまざまな細胞種において利用している。ニューヨークを …
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　ロシアの研究者らは、SpCas9-HF1-plusとAsCas12aに最適化されたガイドRNAを用いることで、オフターゲット効果を検出することなく、60～72％のCCR5ノックアウト効率を達成した。バイオインフォマティクスに支援されたgRNA設計は標的部位の切断を改善し、HIV遺伝子治療の潜在 …
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　抗CRISPRタンパク質（Acr）は細菌やアーケアのCRISPR-Cas免疫防御を阻害するが、既知のAcrのほとんどはCasヌクレアーゼとcrRNAのRNP複合体に作用する。ドイツの研究チームは今回、Riemerella anatipestifer 由来のAcrVIB1が、Cas13bをcrRNAのシンクへと変換し、CRISPR免疫 …
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　転移性去勢抵抗性前立腺癌（castration-resistant prostate cancer: CRPC）に見られる変化において、アンドロゲン受容体（AR）遺伝子座の増幅が、最も頻度が高い。最近、ARのエンハンサーがAR遺伝子本体と共に増幅され、AR転写の増加とアンドロゲン除去療法に対する抵抗性 …
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　高付加価値化学物質の持続可能な生産に向けたリグノセルロース系バイオマスの価値向上において、フェノール系バイオポリマーであるリグニンの複雑さが課題になっている。ベルギーを主とする研究チームが、トウモロコシのリグニン生合成における主要遺伝子であるp-COUMAROYL …
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　エフ・ホフマン・ラ・ロシュを主とする研究チームが、ヒトiPS細胞由来のミクログリアにおける脂質処理経路を解析することを目的として、アレイ型CRISPR-Cas9スクリーニング法を開発し、CRISPR-Cas9技術がアルツハイマー病や神経炎症に関連する脂質調節異常の分子経路の解明 …
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　CRISPRを介した選択的DNA結合または切断はDNA編集に革命をもたらし、塩基編集、プライム編集、大きなDNA断片の操作など、さまざまな機能を可能にした。対照的に、RNA編集ツールの進歩はDNA編集に遅れをとっており、ほとんどの標的RNA編集技術は主に塩基編集に焦点を当てて …
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　ウィーバー症候群は、大頭症、高身長、肥満、脳異常、知的障害、癌感受性の亢進を伴うまれな神経発達障害である。この顕性単一遺伝子病は、重要なヒストンメチル基転移酵素 （histone methyltranseferase）をコードするEZH2 遺伝子の生殖細胞系列変異により発症することが …
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　クリ・デュ・チャット症候群（猫鳴き症候群、5pマイナス症候群; Cri du Chat syndrome, CdCS）は、染色体5p上の 5 - 40 Mbに渡るヘテロ接合性欠失によって引き起こされる深刻な遺伝病である。これまで効果的な治療法はもとより正確な動物モデルも確立されていなかったが、 …
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　CRISPRシステムの研究は現在も続けられているが、RNAガイド機構がどのような進化的経緯で誕生したのかについては、まだよくわかっていない。そこで、ブロード研究所などのFeng Zhangの研究チームにNCBIのEugene V. Kooninの研究チームが加わり、RNA標的CRISPR-Cas13システ …
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　遺伝的相互作用（genetic interaction: GI）のマッピングは、遺伝的ネットワークの複雑性を理解する上で極めて重要である。ドイツの研究チームが今回、RNAを標的とするCRISPRシステムであるCas13dのGIマッピングへの有用性を調べ、GIマッピングに一般的に用いられていきた2 …
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　心血管疾患は世界的な死因の第一位であり、低比重リポ蛋白（LDL）コレステロールとトリグリセリド（中性脂肪）の血中濃度の上昇によって悪化する。これまでの血中脂質濃度を低下させるためのアプローチは、日々の薬物療法に依存しており、患者のアドヒアランスを低下させる …
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　金属イオンは様々な化学的、生物学的、環境的プロセスにおいて重要な役割を果たしている。本総説では、DNAとRNAの触媒反応における新たな化学的メカニズムについて報告する。ゲノム編集技術を通じて生命科学に変革をもたらしつつあるCRISPR-CasシステムにおけるDNA切断の金 …
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　早老症候群（progeria syndromes / プロジェリア症候群）は、老化の特徴をほとんど再現する極めて稀で不治の早老症である。ケンブリッジ医学研究所のDelphine Larrieuらが 今回、マルチパラメーターCRISPRスクリーニングを行い、早老症に関連する複数の細胞表現型をレスキ …
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　ダウン症は、21 番染色体が通常2本のところ、1本過剰で計 3 本となっているトリソミーが原因で発症する遺伝病である。ダウン症の出生前診断や着床前診断は可能になったが、過剰な染色体を除去する遺伝子治療はまだ実現していない。　三重大学の橋詰令太郎講師をはじめとす …
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　単一細胞における個々のRNA分子の多様な動的挙動を理解するには、それらをリアルタイムで高解像度で可視化する必要がある。しかし、修飾されていない内在性RNAの1分子ライブセルイメージングは、一般化可能な方法ではまだ実現されていない。　ノーベル化学賞共同受賞者のJe …
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