個人的には、 亡くなったと思っています。 電車の中にいた場面で何かが崩れるような音がしましたし、 早織や先生が探しに行った時点で電車は既に土砂に埋まってました。 最後に二人が電車から出てきた場面では電車は埋まってませんでしたし、 空も晴れていました。 いつもは立ち入り禁止だった場所にも行けるようになってましたし、 生きにくい世界から解放された死後なのかなと感じました。 ちなみに小説版では、 「二人は未知の世界に行った」と書かれていました。 この監督の作品は最後をぼやかすパターンが多いので、 色々な解釈があっていいと思います。