コナンたち少年探偵団は、人が好い男性・間小吉と知り合う。間の自宅アパートに向かっていると、隣人の小宝粘二と大家の今泉照代が言い争いをしていた。小宝の部屋に空き巣が入り、警察に通報するか否かで揉めていたのだ。今泉は借り手がつかなくなると止めようとするが、間の説得もあり通報することになる。やってきた警察に疑いの目を向けられた間。指紋を提出し潔白を証明しようとするが、翌日やって来たのは捜査一課で……。