今日も平和なランタノイド寮。しかし、そんな彼女たちの平穏な生活を脅かす『黒い影』の気配が…… いち早く気配を察したセリウムさんは酸素さんに相談し、その道のエキスパートを紹介してもらう事に。 はたして、ランタノイド寮の運命は………！？

ある休日。 酸素さんは水素さんとフッ素ちゃんと一緒にショッピングに出かけました。 そしてそこで、水素さんの幼馴染のヘリウムさんと出会います。 《希ガス》であるヘリウムさんはとってもクールで、いつも一人で本ばかり読んでいます。 彼女のことをよく知りたいと酸素さんとフッ素ちゃんは話しかけますが、冷たく あしらうヘリウムさん。その時、ある事件が……

某Ａ葉原にオープンした『元素喫茶』 可愛らしさだけでなく、それぞれの元素オリジナルのサービスも好評で、 多くのご主人様がお店を訪れます。 お店で働いているバナジウムさんに招待されてやってきた酸素さんでしたが、 そこには想像を絶する光景が待っていたのです……

とある6周期タウン、３番地に存在する、女子寮『ランタノイド』 そこはグータラなお姉さんやしっかり者な娘さん、元気な双子や弱気な少女など、 １５人の少女たちが生活を共にする他とは少し変わった場所。 酸素さんはセリウムさんに呼ばれて寮を訪れますが、そこで気になっていた 「ある疑問」を寮のメンバーに聞いてみることに… ランタノイド寮の秘密が、明らかになる！？