SelectionModeプロパティを「ListBox」にすると、複数行を選択できます。

このとき、全ての行を走査して、RowクラスのSelectedプロパティがTrueかどうかを見ることで、すべての選択行の番号を取得することができます（方法１）。
また、RowCollectionクラスのSelectedプロパティで選択行全体のコレクションを取得し、それらのインデックスから同様な番号を取得することもできます（方法２）。

なお、RowクラスのSelectedプロパティを設定することで、任意の行を選択状態にすることが可能です。

※下記サンプルコードでそれぞれの方法を紹介しています。
・ボタン１：方法１による選択行の取得
・ボタン２：方法２による選択行の取得
・ボタン３：任意の行を選択状態にする方法

◎サンプルコード（VB）

Imports C1.Win.C1FlexGrid

Public Class Form1
　　Private Sub Form1_Load(sender As Object, e As EventArgs) Handles MyBase.Load
　　　　C1FlexGrid1.SelectionMode = SelectionModeEnum.ListBox
　　End Sub

　　Private Sub button1_Click(sender As Object, e As EventArgs) Handles button1.Click
　　　　' 選択行の取得（１）
　　　　For i = C1FlexGrid1.Rows.Fixed To C1FlexGrid1.Rows.Count - 1
　　　　　　If (C1FlexGrid1.Rows(i).Selected = True) Then
　　　　　　　　Console.WriteLine(i.ToString() + "行目が選択されています")
　　　　　　End If
　　　　Next
　　　　Console.WriteLine("選択行数：" + C1FlexGrid1.Rows.Selected.Count.ToString())
　　End Sub

　　Private Sub button2_Click(sender As Object, e As EventArgs) Handles button2.Click
　　　　' 選択行の取得（２）
　　　　Dim n As Integer = 0
　　　　For Each r As Row In C1FlexGrid1.Rows.Selected
　　　　　　Console.WriteLine(r.Index.ToString() + "行目が選択されています")
　　　　　　n = n + 1
　　　　Next
　　　　Console.WriteLine("選択行数：" + n.ToString() )
　　End Sub

　　Private Sub button3_Click(sender As Object, e As EventArgs) Handles button3.Click
　　　　' 指定した行の選択
　　　　C1FlexGrid1.Rows(5).Selected = True
　　End Sub
End Class

◎サンプルコード（C#）

using C1.Win.C1FlexGrid;

namespace prj_C1FlexGrid
{
　　public partial class Form1 : Form
　　{
　　　　public Form1()
　　　　{
　　　　　　InitializeComponent();
　　　　}

　　　　private void Form1_Load(object sender, EventArgs e)
　　　　{
　　　　　　c1FlexGrid1.SelectionMode = SelectionModeEnum.ListBox;
　　　　}

　　　　private void button1_Click(object sender, EventArgs e)
　　　　{
　　　　　　// 選択行の取得（１）
　　　　　　for (int i = c1FlexGrid1.Rows.Fixed; i < c1FlexGrid1.Rows.Count; i++)
　　　　　　{
　　　　　　　　if (c1FlexGrid1.Rows[i].Selected == true)
　　　　　　　　{
　　　　　　　　　　Console.WriteLine(i + "行目が選択されています");
　　　　　　　　}
　　　　　　}
　　　　　　Console.WriteLine("選択行数：" + c1FlexGrid1.Rows.Selected.Count);
　　　　}

　　　　private void button2_Click(object sender, EventArgs e)
　　　　{
　　　　　　// 選択行の取得（２）
　　　　　　int n = 0;
　　　　　　foreach (Row r in c1FlexGrid1.Rows.Selected)
　　　　　　{
　　　　　　　　Console.WriteLine(r.Index + "行目が選択されています");
　　　　　　　　n = n + 1;
　　　　　　}
　　　　　　Console.WriteLine("選択行数：" + n);
　　　　}

　　　　private void button3_Click(object sender, EventArgs e)
　　　　{
　　　　　　// 指定した行の選択
　　　　　　c1FlexGrid1.Rows[5].Selected = true;
　　　　}
　　}
}

更新履歴
・2022/07/13 タイトルの変更