コナンたちは東京にやってきた平次、和葉とともに世界最大級のコンクパール「妖精の唇（フェアリーリップ）」が展示されている博物館にやってくる。怪盗キッドがこの宝石を狙っているらしい。鈴木次郎吉のキッドへの挑戦状には「その宝石は全方向から速やかに見ていただける準備をしています」と書かれており……。