1909（明治42）年、実験と数字が好きな10歳の少女・綾子は、最愛の母・房枝（石田ひかり）を病気で失い、「お母さんのような人を助けたい」と決意。父・茂雄（杉本哲太）の反対を押し切り、東京女子医専に進学する。 1926（大正15）年、女子医専を卒業した綾子（葵わかな）は東京帝大医学部附属医院の内科に入局。しかし男尊女卑の時代、綾子は男性医局員たちに冷遇される日々を送る。担当した脚気患者からも、「担当を男性医師に変えてほしい」と要望を出されてしまう。 失意の綾子を救ったのが、医局の先輩医師・香美昇一（林遣都）だった。彼は人付き合いが苦手で研究ばかりしている“変人”だったが、昇一は「君は、医者として日々やるべきことをやればいい」と綾子を鼓舞する。そんな2人がはじめたのは胚芽米の研究。当時、脚気は有効な治療法が確立されていなかったが、昇一はビタミンB1が多く含まれる胚芽米に光明を見出したのだ。