コナン、元太、歩美、光彦は買い物に行ったままなかなか帰ってこない灰原を探し、道端に落ちている赤いマフラーを発見する。それは灰原に懐いている檜垣ミツルの飼い猫・チロのマフラーだった。コナンと灰原は少し前にミツルと仲良くなっていたのだ。井戸の跡に落ちていたチロを見つけてミツルの家に返しに行くコナンたち。だが、家の呼び鈴を鳴らしても無反応。ミツルは留守のようだ。一方の灰原は椅子に縛り付けられていた――。