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What We Do?
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苏仁义/硕士/期刊:HepatoBiliary Surgery and Nutrition/IF=5.296
Extrahepatic organs in the development of non-alcoholic fatty
liver disease in liver transplant patients
AI写作助手
(视频教程
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实时收录全网Online论文,基于BERT自然语言模型,根据关键词或短语(中/英)自动匹配出语义最相近的英文表述方式。非生命科学领域的同学可"自建语料库"。
图例写作工具
(视频教程)
图例是文章中figure的说明文字,本工具实时收录在线SCI论文图例数据,输入关键词即可检索相关语料,素材来源可见原文详情,预览图片可见对应图片
审稿人/回复信
(视频教程)
实时收录在线论文回复信中“一问一答”,选择以审稿人或回复者两种角色,输入关键词,可以获得对应语料及其上下文语境,可提高审稿信和回复信的写作效率。
综述Review
(视频教程)
综述(Review)是对前人研究的总结概括,能提出新的见解更佳,科研初学者可多多尝试。本工具实时收录online的Review文献,提取并归类语料。
个案报道Case
(视频教程)
个案报道(Casereport)是对临床疑难,少见病例的高度总结,NEJM,JAMA等顶级期刊均接收。本工具实时收录online的Casereport文献,提取并归类语料。
综述Review
(视频教程
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综述(Review)是对前人研究的总结概括,能提出新的见解更佳,科研初学者可多多尝试。本工具实时收录online的Review文献,提取并归类语料。
AI降重改写
(无需演示)
基于深度学习模型, 可对英文句子进行同义改写,结合使用AI写作助手(检索文献中的权威表达),Crosscheck查重系统(明确重复内容),可实现精准降重。
场景写作工具
(视频教程
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学术论文有格式化的特点,本工具收录了写作中会遇到的场景及对应表述方式。注意,场景顺序也是写作的逻辑顺序。和AI写作助手协同使用将进一步提高写作效率。
首页
(无需演示)
临床生信之家首页收录了所有数据库,目前包括TCGA,GEO,Target;包括本弹窗内功能在内的所有分析模块均收录于此,交流区和视频教程供大家学习交流。
Target
(无需演示)
TARGET是目前最大的儿童/血液肿瘤数据库。这个模块可对7种肿瘤进行可视化分析,根据特定临床信息、某基因表达量高低进行样本筛选,根据分析类型分为单/多组/高级分析。
CCLE plus
(无需演示)
CCLE是目前最大的肿瘤细胞系测序数据库,包含30多种组织来源的1000多种人类肿瘤细胞系。CCLE plus可进行泛病种细胞系间对比分析,也可进行单病种内多个细胞系间对比。
中文版GEO
(无需演示)
集成数据集筛选(中英文对照)、针对样本信息的关键词筛选;一键实现探针ID转换、去批次效应,数据标准化。可进行包括差异基因、基因相关性和免疫检查点等在内的分析。
细胞亚群注释
(无需演示)
单细胞分析中,细胞亚群注释是一个重要且耗时的步骤。这个工具可以对输入的marker基因列表,自动匹配细胞类型及对应参考文献。
预后分析
(无需演示)
基于TCGA数据,可用于分析单个基因在样本中的预后分层效力,或多个样本间的预后/基因关系;构建多个基因signature的预后模型,也可加入临床变量,构建列线图预后模型。
高级预后分析
(无需演示)
可在构建多个基因signature预后模型基础上,对模型评分高低风险组与免疫评分等其他因素进行相关性分析。是3-6分文献常用的分析思路。
药敏评分
(无需演示)
IC50是评估药物疗效或样本治疗反应的重要指标,这个工具根据目前最大公开药物基因组学数据库癌症药物敏感性基因组学(GDSC),基于样本转录组,预测每个样本的药物治疗反应。
干性评分
(无需演示)
癌症进展涉及分化表型的逐渐丧失和祖细胞/干细胞样特征的获得。本功能使用Cell文章中提供的OCLR算法 ,基于样本的转录组计算干性指数来评估样本的干性程度。
敬请期待
(无需演示)
临床生信之家有计划、持续开发有用的生信分析模块,大家也可以联系我们推荐开发内容。
交流区
(无需演示)
大家有问题和意见可以在这里留言,我们会及时回复大家。
视频教程
(无需演示)
180和911师兄分享的科研心得和工具使用心得,欢迎大家向我们投稿,有福利哦。
生信分析协助
(无需演示)
2019年上线以来,临床生信之家的在线工具已经为大家运行了超过10万次分析,但一些高端的文献生信套路分析、定制化分析,前沿分析等仍然只能通过人工去完成。
透明实验服务
(无需演示)
越来越多的期刊要求生信分析后通过湿实验验证,这里提供“基因”体内外验证实验服务。透明实验即每一个项目均成立工作小群,共同追踪实验进度,讨论进展,便于大家身临其境。
生信零代码
(视频教程
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临床生信之家整合了TCGA,GEO等公共数据库样本,对R语言进行了可视化处理,无需代码基础,在线通过鼠标点击即可完成生信分析、生成高清图及原始数据获取。
TCGA可视化
(无需演示)
对TCGA数据库所有33种肿瘤进行可视化分析,可根据特定临床信息、某基因突变或某基因表达量高低进行样本筛选,根据分析类型分为单组,多组,复杂分析。
单细胞分析
(无需演示)
自2019年登上Nature期刊以来,单细胞测序技术被认为是文章和课题中的高端技术。由于测序价格昂贵,利用他人公开数据进行再分析成为另一选择。这个工具实现零代码单细胞数据分析。
批量生存分析
(无需演示)
是否影响临床预后对基因选择至关重要。这个工具基于TCGA数据库33种肿瘤样本数据,在20000+个全基因中,一键批量找到对生存有影响的基因,还包括批量基因相关性分析和批量表达量分析。
泛癌分析
(无需演示)
泛癌分析指的是对全癌种的分析,常用于文章深化研究成果,或作为课题的背景数据。本工具针对TCGA的33种肿瘤进行泛癌分析,包括预后,表达,免疫相关性,突变等分析。
免疫评分
(无需演示)
免疫是炙手可热的科研领域,这个工具提供了6种算法的免疫评分(不同算法侧重的免疫细胞种类不同),8种经典的免疫检查点分析,也可以通过样本的基因表达量来预测免疫治疗反应。
2023年国自然训练营
(无需演示)
Funding申请对科研者的重要性不言而喻。摒弃“填鸭式”模式,本训练营历时2.5个月,以往年国自然医学部热点方向为切入,分享实战化课题思路设计和标书撰写。希望大家在这能收获标书之精妙,逻辑之华美,爱上写标书!
课题思路助手
(视频教程)
基础科研的课题设计有三要素:基因、信号通路、表型/功能。某个基因通过某信号通路产生某个表型。这里,输入关键词,即可从海量文献中检索与之相关的gene、pathway,按年度分析可尽览其“研究演变”。
国自然数据分析
(视频教程)
通过分析国自然历年数据可以帮助把握研究热点。本系统收录近30年(1989-2019)国家自然科学基金立项标书关键信息,结合多重整合分析,数据图形化展示,历年研究热点和立项标书特点一目了然。
两组比较
(视频教程)
“两组比较”有特定的统计学方法,根据是连续变量(如血压)还是计数变量(如个数),以及不同应用场景又采用不同方法。替换示例数据为自己的数据即可获得统计结果,支持6种顶刊风格的矢量图下载。
≥3组比较
(视频教程)
组间比较中,除了“两组比较”,≥3组的数据间比较同样有特定的统计学方法,根据数据类型和应用场景不同而采用不同方法。计量资料又根据是否采用了分组而不同。同样支持6种矢量图下载。
生存分析
(视频教程)
生存分析是专门针对生存数据的统计方法,有两种场景,一是评估接受了不同干预措施病人预后的差异;二是对病人预后的危险因素的分析。支持作图、6种顶刊风格的PDF矢量图下载,方便AI修改。
相关性分析
(视频教程)
想明确x和y之间的关系程度和变化方向(相同趋势或相反趋势),叫做相关性分析,是危险因素分析(线性回归)的前提,不进行相关性分析而直接进行危险因素分析而得出的回归方程,很容易产生“虚假回归”。
危险因素分析
(视频教程)
在相关性分析获得关系程度和方向的基础上,进一步得到一个x和y的回归方程式,即通过x可以得到y值。根据数据类型不同,又采用不同统计学方法。计量资料又根据是多个因素还是多个因素而不同。
诊断性分析
(视频教程)
研究一些潜在的Biomarker对疾病诊断是否有效,可以使用诊断性分析,准确度和敏感度是诊断指标最重要的两个指标,可以绘制ROC曲线,通过曲线下面积AUC来综合比较不同诊断指标的优劣。
简明统计学
(视频教程)
根据统计分析的场景分为以下六个模块:2组比较,3组比较,生存分析,相关性分析,危险因素分析和诊断性分析(ROC)。每种统计学方法均有示例,直接替换示例数据,即可在线生成统计结果和矢量图下载。
文本查重自助提交系统
(无需演示)
HR获得了iThenticate官方的渠道授权,我们以目前市场价20%的 “成本价”给大家提供Crosscheck查重报告。自助提交,系统自动计算字数后运行,自助下载。2020年系统上线至今,查重稿件数量已破10万篇。
Figcheck图片查重系统
(无需演示)
学术论文的"图片重复" 问题严重影响科研者学术声誉。Figcheck整合了神经网络算法和机器学习模型,可对投稿图片或PDF文献中的图片进行一站式切割,定位,相似度识别,标注,报告输出。本系统为科研者之家公益项目。
期刊查询
(视频教程)
共收录12038本期刊的近5年影响因子走势、中科院/jcr分区,历年发表量、国人占比、自引率等重要信息,评论区为投稿经验交流。
生信之友
(视频教程)
生信因为可以“不做实验”发表article而受到喜爱。接收生信的期刊较为集中,这个工具方便大家能够实时掌握生信可投期刊及其关键信息。
国刊之光
(无需演示)
为响应近日科技部措施,鼓励发表高质量国内期刊论文,这里动态收录了具有国际影响力(影响因子)的国内科技期刊,包含期刊介绍及投稿链接。
“第一篇”选刊
(无需演示)
Review和Letter是初次写作的科研者最适合拿来练手的“第一篇”,这里动态收录了所有期刊自2015年以来,这两种类型的发表数量,以供选刊参考。
期刊查询
(视频教程)
共收录12038本期刊的近5年影响因子走势、分区、发表量、国人占比、自引率等重要信息,评论区为投稿经验区。本板块包括生信之友、第一篇投稿、国刊之光。
选刊助手
(无需演示)
期刊所发表的文章一定程度上体现了其收稿偏好。这个工具通过和期刊当前在线的文章的Title,Keywords或Abstract比对,获得期刊综合匹配指数。
每日文献速递
(视频教程)
每日文献速递每日监控Pubmed全库文献更新,设置追踪策略后,系统每日自动推送过去24小时你所关心的文献更新,带近乎真人翻译,可对感兴趣的文献进行收藏。
风禾云课堂
(无需演示)
是科研者之家粉丝之间的知识交互和社交平台,不同于传统的论坛形式,这里课程和直播是载体,在这个社区能够结识同道,互通有无,相互学习,共同进步。也能通过自己的分享获得收益。
文献单词我爱记
(无需演示)
“文献单词”指的是文献中的高频词汇,有其特定用法,不同专业不同。这个工具提取了33类学科的文献单词,配有音标、发音、解释和文献例句。每天30分钟,持之以恒,相信会对大家提升文章读写能力有很大帮助。
实验很忙
(无需演示)
试剂耗材品牌太多,不知怎么选?实验很忙通过分析海量文献数据,给出客观推荐,并一键链接本地靠谱供应商。所有供应商均已提供:营业执照,联系人身份证和相关产品既往交易发票。是HR旗下的试剂耗材订购平台。
Figdraw在线绘图
(视频教程)
通过Figdraw,可对矢量素材进行拖拉、拆分,编辑,组图后制作符合学术发表要求的高清图。所有素材均由科研者之家绘图部原创制作,正常流程导出后自动授权,无侵权/撤稿风险。
科研日历
(2022年度)
科研日历由Home for Researchers用心打造,每年11月-12月期间发布。由数十位科研一线的师兄师姐分享科研干货经验,每天一个科研tips,伴你成长。2022年度科研日历已经正式发布。
科研置换
局域网 各种线粒体相关抗体、探针 换 人类脂肪细胞系; 局域网 线粒体抗体,mitoSOX 换 mRFP-GFP-LC3细胞系; 南京 请吃大餐 换 TE-1\KYSE-30; 兰州 人源内膜癌、卵巢癌细胞 换 交个朋友吧; 兰州 颗粒细胞,KGN细胞 换 颗粒细胞,KGN细胞; 局域网 各种线粒体相关抗体、探针 换 人类脂肪细胞系; 局域网 线粒体抗体,mitoSOX 换 mRFP-GFP-LC3细胞系; 南京 请吃大餐 换 TE-1\KYSE-30; 兰州 人源内膜癌、卵巢癌细胞 换 交个朋友吧; 兰州 颗粒细胞,KGN细胞 换 颗粒细胞,KGN细胞;
是HR旗下公益的科研试剂耗材置换平台,目前包括质粒,细胞系,抗体和其他板块。科研者可以发布置换,也可以联系发布者。“科研置换,换出友情”,说不定就是一次美好合作的开始呢?
2022年度最新影响因子
(无需演示)
科睿唯安官方每年6月份公布上一年度期刊影响因子,如22年6月发布的即是21年IF,2021年度数据已于2022年6月28日公布,这里包括影响因子特殊点位如3分,5分的突破或跌破。
神器建设中...
(无需演示)
科研者之家的信条是“科研不停,神器不止”,利用生物医学、计算机等交叉学科技术赋能科研效率,“降低门槛,提高效率,创新科研教育模式”是我们的使命。欢迎大家通过邮箱,论坛等告诉我们你在科研工作中的效率困境。