ストーリー
人間=ノー・マジの男性との友情と冒険の物語!
1926年、最凶の闇の魔法使い・グリンデルバルドがヨーロッパから姿を消した。アメリカ・ニューヨークでは、人間=ノー・マジによる魔法使いの排斥運動が熱さを増しつつあった。そんな中、魔法動物学者のニュート(エディ・レッドメイン)がニューヨークを訪れる。彼はトランクに絶滅寸前の魔法動物と彼らの“保護施設”を詰め込んで、世界中で魔法動物の調査や保護にあたっていた。しかし、ひょんなことから銀行に融資を頼みに来た“ノー・マジ”のジェイコブ(ダン・フォグラー)が、ニュートのトランクを取り違え…。何も知らずにトランクを開けたジェイコブは、魔法動物を街に解き放ってしまう!!
アメリカ合衆国魔法議会=マクーザでかつて闇祓いの職に就いていたティナ(キャサリン・ウォーターストン)は、魔法動物を所持し、“ノー・マジ”の前で数々の魔法を使ったニュートを逮捕。しかしマクーザの長官・パーシバル(コリン・ファレル)は、ティナの訴えに耳を貸さず…。無罪釈放となったニュートとジェイコブを自宅に連れ帰るティナ。ジェイコブはティナの妹・クイニー(アリソン・スドル)の優しさに惹かれるが、ニュートはジェイコブを連れてティナの家から抜け出し、逃げ出した魔法動物たちの後を追うことに。一方、正義感の強いティナは、ニュートの正体も目的も知らずに彼のトランクを持ってマクーザへ。しかしその行動が、ニュートとティナを思いがけないピンチに追い込むことになる…!!