![](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="48" height="48"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
さて、そこに実験的に作られた変異ウイルス論文(これまでもざっくりと引用した3件)も加味して、ο株の変異にコメントしていきます。
ο株は？
NTD 14-20変異なし。140–158変異有り。245–264変異なし。←NTDの大事なエリアの変異はざっくり1/3
A67V:機能不明
Δ69-70:実験的回避株PRMS20と同じ
![Image](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="680" height="267"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
1
18
28
Thread
Conversation
T95I:免疫回避、全体構造調整
G142D:免疫回避兼ACE2親和性アップ
Δ143-145:免疫回避想定(PRMS20にも有)
Δ211、L212I:不明
ins214EPE:免疫回避想定(PRMS20のD215G変異代替可能性)
G339D, S371L, S373P, S375F, 不明
K417N:有名。+4の1つ。PRMS20にも
1
18
26
N440K:まずN439Kは有名(ACE2親和性アップ+免疫回避)、+4の1つ。
GuptaはN440Kにも項立てしてて、免疫回避。PRMS20ではこちらを選択している。440が+4の代替になりそうで気になる。
G446S:PRMS20がV445E選択してて免疫回避の可能性。実験も有
さて、473-490はACE2結合する最大に大事なとこです。
![Image](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="679" height="626"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
1
20
28
S477N, T478K:どちらも有名。477はACE2との親和性アップ、478は明らかに親和性下げる方向だけど501,681変異とかと共存で免疫回避兼感染力アップになる。今回変異入りまくってるけどどちらに動くか？
E484A:免疫回避、E484Kほどではない、論文有り
E484Kは超有名、超免疫回避、+4の1つ
![Image](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="475" height="680"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
1
20
32
PRMS20にも当然入る。AはE484K下位互換変異でいいでしょ。
Q493K:可能性:L452Rが490,492からの自由度獲得だったことを考えるとL452R下位互換になるか？ちょっとそれは厳しいか？
G496S, Q498R:不明 。位置的にはここらへんの変異は全部怖い
N501Y:はい、ヤバい。+4の1つ。PRMS20もそりゃ選ぶ。
![Image](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="680" height="510"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
1
23
35
Y505H, T547K:不明
D614G:いつもの。
H655Y:s1/s2 cleavage site。侵入能アップ。
N679K:s1/s2 cleavage site.侵入能アップ。
P681H:有名:s1/s2 cleavage site。侵入能アップ。膜融合力により感染力・毒性上げる。論文上はδのP681Rよりマシ(単体比較)。
N764K:s1/s2 cleavage site関与想定
D796Y:不明
![Image](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="680" height="374"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
1
18
27
N856K:可能性:D614Gが854,859からの自由度上がる方だったこと考えればD614G効果の補強あり得る？
Q954H, N969K, L981F:不明
結局、変異単体の懸念の大小なんて(科学的には面白いのだけど)意味なくて、合わさることで相互作用でどの程度になってるかが大事です。
例えばT478Kは単体では明らかに
1
19
31
マイナス。hACE2との結合阻害側への変異。でもD614G, P681H, T732Aと共存するとむしろ感染力アップ兼免疫回避側へ。
δのP681Rだって単体では膜融合、侵入能驚異ですが、実はL452R, E484Q変異合わせると下がります。
なので、実験結果を待ちましょう。という身も蓋もないオチ。
![Image](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="680" height="516"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
![Image](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="360" height="313"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
1
20
39
ま、でも
レビュー論文で項立てされて1つ1つ取り上げられている有名変異って13個あって、その8個をο株は持ってるよ。
そのレビュー論文についてるFigの有名変異23個のうち、11個が該当ないし下位互換かなって感じだよ。
ってことで、なんとなく研究者たちの懸念の理由が1つ分かって貰えれば。
![Image](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="680" height="654"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
1
25
50
例えば膜融合系で既に分かっている変異が3つ同時に入ってるのはたぶん初で、δのP681Rより弱いのか？3つ合わさるとどうなる？
をまず最初に懸念する人もいるでしょう。
機能不明変異が一番気になる！って人もいるでしょうし。
とりあえずο株、現段階変異まとめは以上です。
1
23
40
あ、当たり前ですが、抗原検査ではどんな変異株であれ原則対応できません。臨床試験やり直さないと精度に疑問残るまま。
PCR？Primer変えるだけです。
変異が前提の世界で空港検疫捨てないで下さい。
いま皆さんが声を上げるべき理由はこれです。
Quote Tweet
![](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
ramos2
@ramos262740691
·
#空港検疫をPCRに戻して下さい
そもそもο株に対応するためにはSGTFやるしかないから、抗原検査じゃ、無理って話。
この「Primerちゃちゃっと作れば終わり」がPCRの強さよね。抗原検査なんか変異起きるたびに「感度０になってないか？」試験やり直ししないといけない。日本してないっぽいけど… twitter.com/mebaruhirame/s…
1
284
327
訂正
レビュー論文で項立てされて1つ1つ取り上げられている有名変異って13個あって、その8個をο株は持ってるよ→
その10個をο株は持ってるよ→
その10個をο株は持ってるよ→2
22
64
Ericがはっきりと切り捨て。
弱毒化してるかも？そんなの今の段階で言えるわけないし、一次ソースの1医師の発言(印象)というのも体系的でもエビデンスでもない、と。
はい、すいません。
他の方も指摘してましたがHopiumなだけに迅速に広がってる状況は危険ですね。
Quote Tweet
Eric Feigl-Ding
@DrEricDing
·
Lots of misinformation now being floated that #Omicron is “mild”. That’s nonsense — based on out-of-context quote. Don’t fall for it — nobody know that much yet. And hospitalizations are still rising in the hardest hit #B11529 dominant provinces in South Africa 
twitter.com/bnodesk/status…
twitter.com/bnodesk/status…Show this thread
2
137
159
あ、一次ソースが本来相手にされない様なあれなのに「弱毒化してるかも」がこれだけTweetに広がってる状況が危険という意味です。
Hopiumだとの指摘はここから。
Quote Tweet
Deepti Gurdasani
@dgurdasani1
·
Narratives around the variant potentially being more transmissible/more able to escape *but* milder shared today may be based on a quote taken out of context. Hopium spreads fast, but we need to wait for the data- In the meantime we need to make plans based on potential threat. twitter.com/BNODesk/status…
1
65
90
僕もこんなTweetしちゃってますが、反省。
きちんとしたデータ＆公式機関の発表を待ちましょう。
Quote Tweet
ramos2
@ramos262740691
·
今回、ラッキーなことに毒性が弱いかもという情報もちらほら(まだ全然信頼性薄いです。公式発表されたりしてない)。
そうなると、なーんだ騒ぎやがって。と言う人もいるでしょう。
でもそういう人以外でいいんで理解してほしいのはこれ。
ワクチンも検査も世界に空白地帯があれば、いつまでも怖いだけ twitter.com/mebaruhirame/s…
Show this thread
1
68
127
今必要なのは確実な防疫措置。
イスラエルが正解。また隔離期間もしっかり持とう。
オランダの61例疑いは件数こそまだ明かされてないものの、複数いるとのこと。それがSGTFなのかシークエンス確定なのか分からんけど。
とすると、空港機内クラスター
隔離でしか防げない
Quote Tweet
ramos2
@ramos262740691
·
【日本政府、霞ヶ関で残業中の方へ】
絶対に入れないで下さい。
空港検疫をPCRに戻し、南ア、香港は例外なく着陸拒否。
お願いします。
こいつの感染力がどの程度か現実データはまだ出ていないし、まだこの大量の変異が弱毒化を産んでいる望みも残っていますが、
今まで知る限りの変異見地で言えば
Show this thread
Replying to
ο株、オランダ13人は確定。48人はまだ疑い。
オランダ保健省の公表みても現在進んでいるシークエンスで13の陽性とだけ書いてあり、まだ増える可能性ありとのいつもの文が続く。
なので13/61で確定なのか、まだシークエンス終わってないのか今はまだ分からず。
rivm.nl/nieuws/coronav
1
60
64
ドイツ1件はシークエンスで確定。
ま、SGTFポジならそうでしょと。
しばらくは、どの国もシークエンスで確定とする流れかな。メインVariantでもないから
Quote Tweet
Kai Klose
@StM_Klose
·
Update: Die Sequenzierung hat das Ergebnis bestätigt - bei dem gestern Morgen bekanntgegebenen Verdachtsfall handelt es sich um die #Omicron-Variante. @CiesekSandra twitter.com/StM_Klose/stat…
1
24
27
デンマーク2例のシークエンスも終了。SGTFポジはやっぱりο株。
SGTFつえぇ
ssi.dk/aktuelt/nyhede
34
41
Show additional replies, including those that may contain offensive content
Show
New to Twitter?
Sign up now to get your own personalized timeline!
Trending now
What’s happening
News
24 minutes ago
日大・田中英寿理事長を脱税容疑で逮捕 東京地検
![](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="240" height="135"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
News · Trending
到着の12人感染
18.4K Tweets
【公式】マイナビ子育て
1 hour ago
【年末年始の帰省、どうする？】今年は2年以上ぶりに帰る？「子育て家庭の年末年始帰省」調査
![](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="120" height="80"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
集英社スポルティーバ
1 hour ago
【12/9～大阪でGPファイナル】カミラ・ワリエワ、「ベストではない」演技で世界最高得点。女子フィギュアはロシア勢の台頭で「国際大会のほうが難しくない」
![](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="90" height="120"><rect fill-opacity="0"/></svg>)