製薬企業で使えるPythonライブラリのインストール方法

はじめに

製薬企業研究者のためのPythonインストール方法で紹介したようにAnacondaをインストールすると、科学計算に使うライブラリはおおむねインストールできるのですが、機械学習などで使われるライブラリやモジュールの一部はまだインストールされていません。
そこで、追加でいくつかライブラリやモジュールをコマンド プロンプトを用いてインストールします。
Python3系の使用を想定しています。

化学系

RDkit

化合物の構造情報などを扱えます。
https://www.rdkit.org/
インストールするには以下のコマンドを実行します。

conda install -c rdkit rdkit

データベース操作

SQL Alchemy

データベース操作を行うことができます。
https://www.sqlalchemy.org/
インストールするには、以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge sqlalchemy

機械学習関連

TensorFlow

深層学習(ディープラーニング)を行うためのライブラリです。
https://www.tensorflow.org/
インストールするには以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge tensorflow

Keras

TensorFlow上で動くニューラルネットワークのライブラリです。
https://keras.io/ja/
インストールするには以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge keras

OpenCV

画像解析に使えるライブラリです。
https://opencv.org/
インストールするには以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge opencv

Scrapy

ウェブスクレイピングを本格的に行うときに使えます。
https://scrapy.org/
インストールするには、以下のコマンドを実行します。

conda install -c conda-forge scrapy

まとめ

ここでは、Anacondaをインストールした後に追加でインストールするライブラリやモジュールのインストール方法について解説しました。
ここで取り上げたもの以外のライブラリをインストールするためのコマンドは、Anaconda Cloudで検索すると分かります。

参考資料・リンク

プログラミング言語Pythonとは?AIや機械学習に使える?

yukiya285
製薬企業研究者/工学博士 大学院でプログラミング挫折→製薬会社に就職→プログラミング再挑戦→AI創薬を担当する「創薬エンジニア」。 フォローしていただくと、企業研究におけるプログラミングの実例を知ることができます。
https://pharma-engineer.com/
ユーザー登録して、Qiitaをもっと便利に使ってみませんか。
  1. あなたにマッチした記事をお届けします
    ユーザーやタグをフォローすることで、あなたが興味を持つ技術分野の情報をまとめてキャッチアップできます
  2. 便利な情報をあとで効率的に読み返せます
    気に入った記事を「ストック」することで、あとからすぐに検索できます
コメント
この記事にコメントはありません。
あなたもコメントしてみませんか :)
すでにアカウントを持っている方は
ユーザーは見つかりませんでした