![](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="600" height="200"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
固定されたツイート
![](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="73" height="73"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
Figure 2再検証。1枚目はオリジナル。2枚目はDanisの1人がもし陽性だったら。3枚目はDanisのデータ除去、発症前データ無しの場合
横軸は潜伏期間を5日と仮定、曝露からの日数を示し、点線が発症日。画像上は偽陰性率（感染しているときに検査して陰性となる確率、1-感度）
acpjournals.org/doi/10.7326/M2
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フォロー
けんもう新型コロナ対策本部
@kenmomd
新型コロナ（COVID-19）嫌儲対策本部のhackmdによるまとめサイト管理者です。hackmd.io/@covid19-kenmo 間違うことも多いと思うので指摘して頂けると嬉しいです。開示すべきCOIはありません。
けんもう新型コロナ対策本部さんのツイート
医療機関での「たいへん」は、「その人が病気である・治療が必要である」ということ以上に、「その周辺」の問題が大きいことも。
問い合わせ先が不明。一つのことを決めるのにお役所と電話のやり取りを何回もする（何時間もかかる）。皆で書類を何枚も書く。必要な物品がない。スタッフが不足。
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"Seoul’s mayor believes the city is demonstrating to the world that economic reopening can only be achieved alongside stringent prevention and containment measures, as well as the humility to pivot, backtrack and admit mistakes."
引用ツイート
![](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="48" height="48"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
Aalisha
@AalishaSahukhan
·
A warning from South Korea: the ‘fantasy’ of returning to normal life ft.com/content/d68d62
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ベイズ統計学の概論的紹介 by #bayes #learningtheory slideshare.net/naokihayashi71 から
松浦さん黒木さん加賀谷さんと強い人々にご紹介いただき、4000viewを超えました。ありがとうございます。
![](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="240" height="135"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
ベイズ統計学の概論的紹介
ベイズ統計学の基礎概念からW理論まで概論的に紹介するスライドです．数理・計算科学チュートリアル実践のチュートリアル資料です．引用しているipynbは * http://nhayashi.main.jp/codes/BayesStatAbstIntro.zip * https://github.com/chijan…
slideshare.net
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#統計 #Julia言語
P値函数がプロットしてあれば、有意水準の横線を引くことによって、任意の信頼係数の信頼区間の様子がわかります。
特定のパラメーターのP値や信頼区間はP値函数が持つ豊富な情報の一部分を切り取ったものに過ぎません。
nbviewer.jupyter.org/gist/genkuroki
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="360" height="291"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="360" height="292"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="360" height="294"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
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はえ〜
引用ツイート
黒木玄 Gen Kuroki
@genkuroki
·
#統計 R言語のbinom.testがデフォルトで表示するClopper-Pearsonの信頼区間は同時に表示されるp値と整合性がありません。
パラメーターpが95%信頼区間を外れているのに、p値が5%を超える場合が出て来てしまう。
ソースコード↓
nbviewer.jupyter.org/gist/genkuroki
続く
twitter.com/kenmomd/status
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![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="680" height="561"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
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プレスリリースが先行したというデキサメタゾン。さてどうなるか
引用ツイート
Atul Gawande
@Atul_Gawande
·
It will be great news if dexamethasone, a cheap steroid, really does cut deaths by 1/3 in ventilated patients with COVID19, but after all the retractions and walk backs, it is unacceptable to tout study results by press release without releasing the paper. recoverytrial.net/files/recovery
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これスウェーデン今度は若年層で拡大してきてるのか
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="680" height="505"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
引用ツイート
Dr Zoë Hyde
@DrZoeHyde
·
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="240" height="162"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
Data for the most recent week (11-17 May), show that 6.1% of the population in #Sweden have #SARSCoV2 antibodies.
By age group:
0-19: 7.5%
20-64: 6.5%
65-95: 2.9%
Herd immunity would require at least 60%; the epidemic is far from over. #COVID19
folkhalsomyndigheten.se/contentassets/
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Davies, N.G., Klepac, P., Liu, Y. et al. Age-dependent effects in the transmission and control of COVID-19 epidemics. Nat Med (2020).
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We compared the effect of closing schools for COVID-19 and for influenza-like illnesses, using the different distributions of susceptibility and clinical symptoms for those infections.
We estimated the Covid values, and influenza-like are examples (not estimated).
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="505" height="182"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
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New paper out finding lower SARS-CoV-2 susceptibility in children. nature.com/articles/s4159
We found that children were about half as susceptible to infection as adults, and were less likely to show symptoms if infected.
Colours are countries, grey is the consensus fit.
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="680" height="345"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
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おまけ：特異度90%の場合の陽性的中率を追加したもの
事前確率10%なら事後確率43.8％ｗｗ
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="680" height="680"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
引用ツイート
けんもう新型コロナ対策本部
@kenmomd
·
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="240" height="117"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="120" height="61"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="120" height="58"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
Abbott、Rocheの各抗体検査キットの有病率による陽性的中率、陰性的中率の変化のグラフ
1. 検査前確率1%未満を拡大
2. 以前PCR検査のグラフでやったような、検査前確率を20%未満、検査後確率90%以上の部分を拡大したもの
3. PCR検査で感度70%、特異度99%〜99.99％のとすると陽性的中率がどう変わるか
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Abbott、Rocheの各抗体検査キットの有病率による陽性的中率、陰性的中率の変化のグラフ
1. 検査前確率1%未満を拡大
2. 以前PCR検査のグラフでやったような、検査前確率を20%未満、検査後確率90%以上の部分を拡大したもの
3. PCR検査で感度70%、特異度99%〜99.99％のとすると陽性的中率がどう変わるか
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="679" height="332"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="360" height="183"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
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一応信頼区間の上限か、キット単体だとそれらしい数字ではある
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東京都0.1%だったらIFR高過ぎだろと思ったけど、板橋、豊島、練馬区の3区からの抽出が理由の可能性もあるのか。しかし練馬区しか死亡数が分からない
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【悲報】理研研究員さん、成果報告書で「顕著」を「嫌儲」と書いてしまう 隠れケンモメンバレか [832924924]
leia.5ch.net/test/read.cgi/
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とりあえずロシュ：感度0.867、特異度0.998、アボット：感度0.929、特異度0.996くらいにしてみよう
引用ツイート
けんもう新型コロナ対策本部
@kenmomd
·
返信先: @kenmomdさん, @as_as0602さん
感度は重症度や患者次第で変わる可能性があるのではと思ってたけど、PHEの結果を見るにそうだった。ロシュがアボットより少し感度低め。特異度はFDAのデータで良さそう
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Abbottの抗体検査キットの性能調べようとしたら公式アカがコピペマシーンと化してて草
引用ツイート
Abbott
@AbbottNews
·
返信先: @Tigrress_さん
Thanks for reaching out. Data for our COVID-19 antibody blood test on our Alinity i system show reliable results with 99.6% specificity and 100% sensitivity for patients tested 14 days after symptoms began. You can learn more here: abbo.tt/3hq1b8V
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![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="360" height="238"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="466" height="680"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="360" height="269"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="360" height="273"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
変更点
厚労省は抗原検査キットについて、発症2～9日目に陰性だった場合、PCR再検査を不要とすると明らかにした。
その後の研究でウイルス量が多い発症2～9日目は、抗原検査とPCR検査の陽性一致率が高いことが判明。偽陰性リスクは低いとして、PCR再検査は必要ないと判断。
r.nikkei.com/article/DGXMZO
引用ツイート
けんもう新型コロナ対策本部
@kenmomd
·
厚労省の抗原検査のガイドライン 5月13日 mhlw.go.jp/content/000630
PCR 検査を基準とした試験成績1(n=72)
陽性一致率 37%(10/27)、陰性一致率 98% (44/45)
試験成績2(n=124)
陽性一致率 66.7%(16/24 )、陰性一致率 100%(100 /100)
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![画像](data:image/svg+xml,<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="594" height="680"><rect fill-opacity="0"/></svg>)
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> なお、現時点では、退院判定の際の活用については、検出に PCR 検査と比較して一定以上のウイルス量が必要なこと、PCR 検査との一致性に関するエビデンスが十分ではないことから、適さない。
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