なぜ動物の交尾はバックばかり？～魚の体内受精の起源から陸上四肢動物まで～
WordPressでサイトの作成を行っているのだが，「どのような検索がされたのか」というところを眺めていたところ「 なぜ動物はバックばかり？ 」という検索履歴を見てしまった 確かに我々人間からしてみれば他の動物の交尾時における体位多様性の無さに疑問を覚えるのかもしれない(ヒトが異常なだけだが) 例え…
OpenPose for Unity で人の動きを二次元に落とし込む
関連記事 Ubuntu18.10にopenposeをインストール(環境構築) 前提条件および目的 上記のようにOpenPoseがインストールされている状態が前提． この記事が参考になる 【2019.4最新】UnityでOpenPoseが使えるまでのインストール（約２時間） 今回はWindows 10…
ケラチンの進化が陸上生活を可能にさせた？
「ケラチン」と聞いて何を思い浮かべるだろうか． 聞いたことがある，という人はおそらく髪の毛や爪を想像するだろう． その通り髪の毛や爪に含まれる「細胞骨格」の一種，中間径フィラメントであるケラチンは進化的にも非常に面白いタンパク質である． あんまり一般的に馴染みがないのか，髪の毛の成分であるにもかかわ…
ポリプテルスの飼い方
ポリプテルスが今密かにアクアリストの中でブームになっています． ポリプテルスが発見されたのはかのナポレオンの時代 ナポレオンがエジプト遠征に行ったときにキュビエがポリプテルスを持ち帰り，新種として記載されたことが人類の文献におけるポリプテルスの最初の登場です．2019年現在でもポリプテルス・セネガル…
【BLAST】tblastnで Could not calculate ungapped Karlin-Altschul parameters due to an invalid query sequence or its translation. Please verify the query sequence(s) and/or filtering options と出る
アホみたいなミスをして時間を溶かしたので万が一こんなエラーで悩んでいる一のための備忘録 問題点 makeblastdbでデータベースを作成後，クエリーとしてとあるmRNAの配列を用意し，tblastnにかけた． その結果，Could not calculate ungapped Karlin-Alt…
魚が陸に上がるとき 〜最初は口で空気を吸わなかった？〜
魚陸上化関連記事 シーラカンスは陸に上がったのか？ 魚が陸に上がるとき 〜尿素代謝〜 古代の魚の呼吸事情 古代の魚は低酸素の水の中でも生きられるように肺を獲得してきた。 今私たちヒトは口と鼻で空気を吸うことができ、基本的に陸上四肢動物においては口を通じて主に呼吸を行っている。両生類も見ていると口とい…
シーラカンスは陸に上がったのか？
はじめに 先日の某学祭においてシーラカンスの解説員を勤めていた．時給1000円の交通費なしという流石某工大と言わんばかりの待遇だったが，進化生物学がなかなか社会に直接的な利益をもたらすことが難しい以上，こうした教育的な活動を行って社会貢献をする他ないことを重々承知しているので引き受けた． すずかけ台…
CPSIIIの進化の話
クララのCPS I-likeな酵素 前回の記事でCPS(Carbamoyl phosphate synthetase; カルバモイルリン酸シンターゼ)の進化について少しまとめた． 記事中で， アンモニアを基質とするCPS Iを持つようになったのがハイギョ以降、つまり肉鰭類のうち陸上に上がった/上がる…
魚が陸に上がるとき 〜尿素代謝〜
私は魚の陸上適応進化に強い興味を抱いており、今文献を漁っているのでそれの軽いまとめとして先行研究を日本語でまとめておく。 (もし、同じように魚の陸上への適応進化に興味を抱いている学生・研究者の方がいましたら、コメント等お待ちしております) 背景 肺呼吸の獲得 魚が陸に上がるとき、様々な変化が起きたこ…
【Python & Anaconda】PythonコードをWindowsで動かせるexe形式にする
※今回はexe形式にするため、Windows上での動作確認のみを行います。また、GUIのAnacondaでのみ確認しています。Linux上でも(ほぼ)同様の手順で実行ファイルができます。 Pythonは3.7.3、pyinstallerは3.4 バイト先の会社で使うスクリプトをAnacondaで環境…