交通量調査のアルバイトって会社にばれるでしょうか？

副業が会社にバレる最多の理由は税金関係です。
そこで重要なのが本業の会社側（以下Ａ）よりも、今回されたアルバイトの会社側（以下Ｂ）には質問者様がＡから主たる給与を得ている者であることが知れているのか否か？
また知れていたとしてＢでどのような処理がなされているか？です。

Ａは税金等天引きで給与を払っていますが、Ｂが厳密な会計処理をいていた場合、税金関係で総所得のつじつまが合わないことがＡにバレるわけです。
今回の場合給料は手渡しですので、言わなければまずＡにバレることはないと思います。（同じようなケースの経験談です…）
厳密には少しでも副収入があったら別途納税・確定申告しなければいけませんから、所得隠しです。税務署から摘発されたら脱税認定です。しかしこれも手渡しですし、まずバレることはないと思います。

私は一般に募集されているバイトというより、知人づてで手伝いを頼まれて給料を受け取ってましたが（手渡し）、私も本業にバレることと脱税摘発受けるのが怖かったので、この副収入を何も申告していない旨をバイト側に伝えていました。
そこは自営業レベルの所でしたので長さんも「あぁ分かった、いいようにしとくわ（笑）」ぐらいでしたけど。

一番怖いのは、Ｂに税務調査が入って、雇用者名簿の中に質問者さんを見て「明らかに大学生バイトではない」→もう少し素性を詳しく調べよう→Ａという会社の社員であることが発覚→Ａに調査が入り、バレる→所得隠しによる追徴課税…
という、会社にもバレて脱税もバレるパターンではないでしょうか。

でもたぶん黙っておけばまず大丈夫だと思いますよ。
私も少しビクビクしてましたが、６年やって何もなかったですから。