Final Missionは｢涅槃｣｢メギド｣｢ヴァダー｣の3つのﾙｰﾄがあり、それぞれでｸﾘｱ難度も変わってきます。

1.涅槃ﾙｰﾄ(簡単)
Mission 12｢簗｣でRankＳを取りﾗﾃｨｱﾗを雇用可能にするのが必須です。
Mission X05で｢土竜叩き｣を選択します。その時ﾗﾃｨｱﾗとﾒｸﾞを雇用してる状態でｸﾘｱすれば、次がSpecial Mission｢業｣になるのでｸﾘｱします。
しばらく進めてMission X11で｢蟻地獄｣を選択すれば｢強襲｣、｢蟻の門渡り｣、｢涅槃｣となります。

2.メギドﾙｰﾄ(普通)
涅槃ﾙｰﾄとヴァダーﾙｰﾄのどちらにもならないように選択していけばMission X12が｢防壁｣になり、その後｢仕事人｣、｢メギド｣となります。
Special Mission｢業｣を受けないようにすれば楽にメギドﾙｰﾄにいけます。

3.ヴァダーﾙｰﾄ(難しい)
涅槃ﾙｰﾄ、メギドﾙｰﾄの両方ｸﾘｱするのが必須なので早くても3周目にならないと選択出来ないﾙｰﾄです。
Mission 04で｢テンペスト｣を選択。
少し進めてMission 08｢死守｣の時、残り90秒になったら出てくる敵=暗殺者を5体全部撃破します。
｢テンペスト｣と暗殺者撃破の両方を達成するとMission 16｢激震｣ｸﾘｱ後、Special Mission｢影武者｣になるのでｸﾘｱします。
そして前述のSpecial Mission｢業｣を受ければMission X12が｢探検｣になり、｢地獄釜｣、｢ヴァダー｣となります。