2071年、火星。ハロウィンを目前にしたクレーター都市アルバシティーの高速道路で爆破事件が起こった。それは、正体不明のバイオ兵器を使用したテロで、火星政府はその事件の首謀者と思われるテロリストに未曾有の賞金3億ウーロンをかけた。 相変わらずの貧乏状態が続いていたビバップ号クルー4人と1匹［賞金稼ぎのスパイク、その相棒ジェット、女賞金稼ぎのフェイ、天才ハッカー･エド、そして犬のアイン］は、この史上最高額と言われる懸賞金に、当然目の色を変えてこの事件に飛びついた。そして、次第に浮かび上がる事件の真相。陰謀と謎が交錯し、一触即発の状況の中、物語はとてつもない終幕へ向かって突き進んでいく･･･。

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