このブログを下記に移転します。
化学構造式エディタまとめ
http://kiriyamadouro.esy.es/
とりあえず内容を移しただけで、体裁等はほとんどいじくれていません。
これから順次修正・追加する予定です。こちらのブログの内容を残すか削除するかは未定です。
2150年12月12日
2100年01月01日
化学構造式エディタまとめ
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'14/10/14更新
過去の記事を踏まえて化学構造式エディタをまとめる記事です。
'14/10/14更新
過去の記事を踏まえて化学構造式エディタをまとめる記事です。
| ソフト名 | 日 本 語 |
無料 or 有料 |
おすすめ度 | 開発元 | ライセンス | 対応ＯＳ | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ChemDraw [公式サイト] |
可 | 有料 | ★★★★★ | PerkinElmer (CambridgeSoft) |
商用 | Windows, Mac | 化学業界の事実上の標準ソフト |
| MarvinSketch [公式サイト] |
不可 | 無料 (個人利用) |
★★★★ | ChemAxon | 商用 | Java： Windows, Mac, Linux等 |
無料で使用でき、多彩な機能 |
| ACD/ ChemSketch [公式サイト] |
不可 | 無料 (個人利用) |
★★★ | ACD/Labs | 商用 | Windows | ChemDrawの代替ソフトとして知られる。 Windowsユーザーなら楽に導入可 |
| SketchEI [公式サイト] |
不可 | 無料 | ★★★ | Alex M. Clark | GPL | Java： Windows, Mac, Linux等 |
楽に導入でき、使い勝手も良い。 |
| BKChem [公式サイト] |
可 | 無料 | ★★★ | Beda Kosata | GPL | phython： Windows, Mac, Linux等 |
個人で開発。操作に癖はあるが機能は良い。 |
| Accelrys Draw
(ISIS/Draw SymyxDraw) [公式サイト] |
不可 | 有料 | ★★ | Accelrys | 商用 | Windows | ChemDrawの代替ソフトとして知られる。 開発元の変遷と対応ファイルフォーマットの少なさが気になる。 |
| JChemPaint [公式サイト] |
不可 | 無料 | ★★ | The CDK Project | GPL | Java： Windows, Mac, Linux等 |
若干動作がもっさりだが、 マルチプラットフォームであり、コミュニティベースでの開発も大きなポイント。 |
2050年01月01日
3D化学構造ビュワー・エディタまとめ
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'14/11/29更新
過去の記事を踏まえて3D化学構造ビュワー・エディタをまとめる記事です。
'14/11/29更新
過去の記事を踏まえて3D化学構造ビュワー・エディタをまとめる記事です。
| ソフト名 | 日 本 語 |
無料 or 有料 |
おすすめ度 | 開発元 | ライセンス | 対応ＯＳ | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Jmol | 可 | 無料 | ★★★★ | Jmol development team |
LGPL | Java： Windows, Mac, Linux等 |
化学構造を３Dで見たい場合は第一候補として導入すべきソフト |
| Avogadro | 無料 | ★★★★ | |||||
| Pymol | ※ | ★★★★ | |||||
| QuteMol | 無料 | ★★★★ | |||||
2030年01月01日
化学更新予定等メモ
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私的メモ
まとめる予定のソフト('15/1/9更新)
２D
ChemDoodle
Chemistry 4-D Draw
DrawIt
３D
pymol
PMV(ePMV)
Discovery Studio Visualizer
Ascalaph
Facio
Winmostar
Qutemol
Cuemol
Spartan
まとめない予定
XyMTeX
XDrawChem
化学式を表現するPowerPointアドイン
個別の項目は作らない
2D
EasyChem Mac, Linuxのみ。更新が2005年でとまっている。機能が少なすぎる、使用感が悪い。
Gchempaint Linuxのみ対応？ Gnome系のソフト。更新が2008年でとまっている。使い勝手はわりかしよい。
ChemTool Linuxのみ対応。使いにくい。
3D
Molden
BALLView
molekel プロジェクトサイトが完全に消失。最終版は5.4らしい。検索すればDLできるサイトがいくつか見つかる。
それ以外のバージョンは
http://www.bioinformatics.org/ftp/pub/molekel/
Swiss National Supercomputing Centre(cscs)のサイトにも全く情報がない。わりかし好きなソフトだっただけに残念。
gOpenMol 公式サイトが消失している。
公式サイトへのリンクや画像の添付は後ほどまとめるやる予定。
私的メモ
まとめる予定のソフト('15/1/9更新)
２D
ChemDoodle
Chemistry 4-D Draw
DrawIt
３D
pymol
PMV(ePMV)
Discovery Studio Visualizer
Ascalaph
Facio
Winmostar
Qutemol
Cuemol
Spartan
まとめない予定
XyMTeX
XDrawChem
化学式を表現するPowerPointアドイン
個別の項目は作らない
2D
EasyChem Mac, Linuxのみ。更新が2005年でとまっている。機能が少なすぎる、使用感が悪い。
Gchempaint Linuxのみ対応？ Gnome系のソフト。更新が2008年でとまっている。使い勝手はわりかしよい。
ChemTool Linuxのみ対応。使いにくい。
3D
Molden
BALLView
molekel プロジェクトサイトが完全に消失。最終版は5.4らしい。検索すればDLできるサイトがいくつか見つかる。
それ以外のバージョンは
http://www.bioinformatics.org/ftp/pub/molekel/
Swiss National Supercomputing Centre(cscs)のサイトにも全く情報がない。わりかし好きなソフトだっただけに残念。
gOpenMol 公式サイトが消失している。
公式サイトへのリンクや画像の添付は後ほどまとめるやる予定。
タグ：化学
2014年11月29日
３Ｄ化学構造ビュワーソフトPymolについて
ソフトウェア名：Pymol
ライセンス：Pythonライセンス
対応OS:クロスプラットフォーム(Python：Windows, Mac, Linux等で使用可能)
最新版：v1.7.2 2014/8/4
開発元：Schrödinger, Inc.
日本語：不可
無料or有料：公式バイナリ(実行ソフト)は有料。ソースまたは非公式バイナリは無料。ただし、教員・生徒は公式バイナリも無料。
ファイルフォーマット：
・インプット：mol, pdb, xyz等の様々な形式
・アウトプット：gif, jpeg, png, pov-ray形式, 3Dモデル(VRML, X3D, IDTF ,Maya)等
※この記事は作成途中です。
ライセンス：Pythonライセンス
対応OS:クロスプラットフォーム(Python：Windows, Mac, Linux等で使用可能)
最新版：v1.7.2 2014/8/4
開発元：Schrödinger, Inc.
日本語：不可
無料or有料：公式バイナリ(実行ソフト)は有料。ソースまたは非公式バイナリは無料。ただし、教員・生徒は公式バイナリも無料。
ファイルフォーマット：
・インプット：mol, pdb, xyz等の様々な形式
・アウトプット：gif, jpeg, png, pov-ray形式, 3Dモデル(VRML, X3D, IDTF ,Maya)等
※この記事は作成途中です。