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神社合祀(じんじゃごうし)とは、神社の合併政策のことである。神社整理ともいう。複数の神社の祭神を一つの神社に合祀（いわゆる稲八金天神社）させるか、もしくは一つの神社の境内社にまとめて遷座させ、その他の神社を廃することによって、神社の数を減らすというもの。主に明治時代末期に行われたものをさす。
明治末期の神社合祀
神社合祀の目的は、神社の数を減らし残った神社に経費を集中させることで一定基準以上の設備・財産を備えさせ、神社の威厳を保たせて、神社の継続的経営を確立させることにあった。また、教派神道は宗教として認めるが、神社は宗教ではなく「国家の宗祀」であるという明治政府の国家原則（宗・政・祭体制に従って、地方公共団体から府県社以下神社に公費の供進を実現させるために、財政が負担できるまでに神社の数を減らすことにもあった。
神社中心説とは地方の自治は神社を中心に行なわれるべきだという考えのことで、これにより合祀政策に一町村一神社の基準が当てはめられることとなった。神社の氏子区域と行政区画を一致させることで、町村唯一の神社を地域活動の中心にさせようとしたのである。
神社合祀政策は1906年(明治39年)の勅令によって進められ、全国で1914年までに約20万社あった神社の7万社が取り壊された。特に合祀政策が甚だしかったのは三重県で、県下全神社のおよそ9割が廃されることとなった。和歌山県や愛媛県もそれについで合祀政策が進められた。しかし、この政策を進めるのは知事の裁量に任されたため、その実行の程度は地域差が出るものとなり、京都府では1割程度ですんだ。
この官僚的合理主義に基づいた神社合祀政策は、必ずしも氏子崇敬者の意に即して行なわれなかった。当然のことながら、生活集落と行政区画は一致するとは限らず、ところによっては合祀で氏神が居住地からはほど遠い場所に移されて、氏子が氏神参拝に行くことができなくなった地域もある。合祀を拒んだ神社もあったが、所によってはなかば強制的に合祀が行なわれた。
特に腹立たしいのが、鎮守の森の木が、この合祀運動に便乗して伐採され、売りに出されたことです。日本古来の考え方は、森に神が住んでいらっしゃる・・・そして、森に動植物も住んでいて、神を守っていらっしゃる・・・というものだったと思うのですが。
こうした事態に立ち上がり、神社合祀反対運動に動いた人物がいました。
南方熊楠です。南方熊楠は、「粘菌」など生物・植物を中心に研究を行っていた、明治時代の研究者です。彼は天才でありながら、奇人（変人）とも言われる場合のある人ですが、それは世界の天才・偉人によくあることであるでしょう。後々、「超人列伝」で彼の人生を振り返ってみます。
さて、南方熊楠は、どのようにして神社合祀反対運動を行うに至ったのでしょうか？
一冊の本「南方熊楠（原田健一 著）」より引用したいと思います。
P.90
ところで南方熊楠が政府の「神社合祀令」から神社合祀反対意見を世に問うまでの間、どう考えていたか不明に思われていた。しかし1993年、山本幸憲によって熊楠のリスター宛書簡がロンドンで発掘され、南方邸に所蔵されていたリスターの書簡とあわせられ、『南方熊楠・リスター書簡』として刊行されることになった。熊楠が、この間、どう考えていたかが明らかになったのである。
リスター父娘との往復書簡のなかで、南方熊楠は父娘に、神社の社のなかに粘菌のみならず、多くの貴重な生物が棲息していることを報告している。そして、典型的な例として、「糸田猿神祠」をあげている。南方熊楠は一九○七年四月に、合祀された糸田猿神の址にしばしば訪れ、七月四日、糸田猿神址にあったタブノキの朽木に附いた粘菌の新種を発見する。（中略）しかし、この貴重な生物の採集場であった糸田猿神址のタブノキの朽木は取り払われ、さらに跡地の樹木は伐採に至る。熊楠はこうした経緯を、リスター父娘にそのつど通信している。（中略）熊楠はそこできわめて意図的かつ劇的に、愉快だった採集旅行と、その旅行の終わりに見た「糸田猿神祠」合祀による悲劇を語る。そして、その結論として次のように述べている。
「こうした野蛮な行為は、この国では近年日常的におこなわれており、やがて日本人の美的感覚だけでなく、愛国的な感覚をも壊し、あともどりできないところに追い込むことになるでしょう。わたしはラスキンやカーライルと共に、近代の進化が本当の意味で人間に恩恵をもたらすものかどうか疑っています」
（中略）
神社合祀は、たしかに政府の「神社合祀令」によって引き起こされたものであった。そのため、その施行は個々バラバラに無統制に、その地域のなかで散発的に展開していた。しかし、かつてタブーによって神聖な領域として守られていた神社とその社は、徐々に合祀の進行とともにその社の樹木の伐採という物理的な行為によって、人の心を変化させた。最初はおそるおそるだったものが、しだいに当たり前のものへと、人々の意識全体を変容させていったのだった。
（中略）
当時の現実でいえば、神社合祀で伐り取られたクスノキから樟脳がつくられており、その日本産の樟脳は国際的な商品市場で、大きなパーセンテージを占めていたことを考えれば、帝国主義が生みだした植民地的な経済の渦中に、神社合祀があったとも了解される。
（中略）
ひとりの人間が一つの運動を、文化的、あるいは社会、政治的運動にしろ、担おうと覚悟するにいたるには、私憤と公憤とが分かち難いほどに熱せられなければならない。
その後、南方熊楠は新聞報道を使って、神社合祀反対運動を展開します。
重要なことは、政府の間違った合理主義・効率至上主義による政策だけではなく、赤文字で記したとおり「人々も、だんだん慣れて当たり前のことと思うようになった」ことです。
現代でも、TPPや道州制が、「当たり前のように」議論され、進められています。
日本人の価値観は、いったいどうなってしまったのでしょうか？完全に骨抜きです。腹立たしい限りです。
その一方で、日本人には、この南方熊楠や、現在で挙げるならば中野剛志氏や藤井聡氏、適菜収氏のように、新自由主義に抵抗されている方もいらっしゃるので、まだまだグローバリズムへの対抗も諦めてはいけないのだと考えています。
なお、この南方熊楠という天才・超人は、他にも尋常ではないエピソードが多数あります。本を買って読むのも良いかもしれません。また、後々、「超人列伝」の記事で取り上げます。