戦いの舞台は日本の首都、東京。

ファントムという謎の人物が暗躍し、
美しきデュエリストたちを戦いへと誘う。
F.Aと呼ばれる武具を手にしたデュエリストたちの願いは何か?
ファントムの狙いは?

そして、戦いを制し、願いを叶えるのはどのデュエリストなのか?