カードコンプリートを目指す際には次の2点に注意。

(1) No.98｢ネミングウェイ｣のカード
DISC3でのみしか入手できない。
デザートエンプレス/主の間で確実に拾う事ができるので、忘れずに回収したい。また、トレノで開催されるカード大会の2回戦の相手になる可能性のある｢雑居区のマリオ｣も使用してくる。

(2) No.81〜No.88｢乗り物系｣のカード
入手方法が4本腕の男から奪うか、チョコボのお宝関係のみ。
トレジャーハンターランクイベントを最後まで進めてしまうと(最短でDISC3・飛空艇ヒルダガルデ3号入手後)、二度と4本腕の男に会えなくなるので、間違っても捨ててしまわない様に注意。
なお、No.88｢ヴィルトガンス｣のカードのみは無制限に入手できる(ミニゲーム｢ここほれ！チョコボ｣の景品)。

以上の2点に注意していれば、DISC4からカードを集め始めてもコンプリートは可能。