先日「風景から歩行者を消す手軽な方法」をMathematicaで実装したのですが、「なんでMathematica？ 持ってないし。高いじゃん」という意見があったので、フリーソフトウェアを使う方法を紹介しましょう。「風景から歩行者が消えていく様子」が要らないならこれで十分かも知れません。（Raspberry PiのMathematicaなら無料なのですが、非力なのでこの話には使いにくいでしょう。）
Ubuntuで試します。（WindowsでもFFmpegとImageMagickを入れればできるかもしれません。）
sudo apt-get install libav-tools imagemagick
ffmpegで動画を画像に分解し、convertでまとめます。（Ubuntu 14.04ではffmpegをavconvに置き換えてください。）
ffmpeg -i movie.mov -f image2 %d.png convert -evaluate-sequence mean *.png mean.jpg
meanをmedianに置き換えれば平均ではなく中央値を使うようになりますが、処理時間がかなり増えます。