論文

• Yuki Kagawa, Noriko Horita, Hideki Taniguchi, Satoshi Tsuneda.
  "Modeling of stem cell dynamics in human colonic crypts in silico"
  Journal of Gastroenterology 49 (2014) 263-269 [PubMed]
  

• Yuki Kagawa and Atsuko Takamatsu.
  "Synchronization and spatiotemporal patterns in coupled phase oscillators on a weighted planar network"
  Physical Review E 79 (2009) 046216 [PubMed]
  

• Yuki Kagawa.
  "Effect of fluctuation in step size on actin-myosin sliding motion"
  Physical Review E 75 (2007) 011923 [PubMed]
  

• Yuki Kagawa and Yoshimi Tsuchiya.
  "Stepping motion of the organelle in a perfused characean cell"
  FEBS Letters 546 (2003) 209-212 [PubMed]
  

• Yuki Kagawa and Yoshimi Tsuchiya.
  "Stochasticity of the Step Size in the Force Generating Process Due to a Single Myosin Molecule"
  Bulletin of Mathematical Biology 64 (2002) 407-419 [PubMed]
  

• Hiromi Miyoshi, Yuki Kagawa and Yoshimi Tsuchiya.
  "Chaotic behavior in the random motions of Amoeba proteus"
  Protoplasma 216 (2001) 66-70

• Yuki Kagawa, Yuuki Mizukami and Yoshimi Tsuchiya.
  "Molecular Friction due to a Small Number of Motor Proteins in a Characean Motility Assay System"
  Journal of the Physical Society of Japan 68 (1999) 1040-1048 [J-STAGE]
  

Preprint

• Yuki Kagawa and Atsuko Takamatsu.
  "Collective behavior in coupled dynamical systems on two-dimensional weighted networks: A step toward understanding adaptive behavior of true slime mold"
  arXiv:0904.1456 (2009)

総説

• 松本慎也, 加川友己, 常田聡
  複合微生物系の挙動を表現可能な数理モデル
  化学工学 76(11), (2012) 671-673
  

Proceedings

• 堀田徳子, 松本慎也, 加川友己, 谷口英樹, 常田聡
  結腸陰窩における細胞増殖分化の時空間ダイナミクス
  京都大学数理解析研究所講究録 No.1663 (2009) 188-193
  

• 加川友己, 伊藤昌輝, 高松敦子
  重み付き2次元ネットワーク上の結合力学系における協同現象　〜真正粘菌変形体の適応行動発現の解明にむけて〜
  第20回自律分散システム・シンポジウム資料 (2008) 353-358
  

• Atsuko Takamatsu, Masateru Ito and Yuki Kagawa
  "Network geometry analysis in plasmodial slime mold"
  Proc. of 2nd International Symposium on Mobiligence (2007) 275-278
  

• Yuki Kagawa, Timothy L. Megraw and Rudolf Oldenbourg
  "Cell division dynamics of Drosophila Kc cells without functional mitotic centrosomes"
  Biol. Bull. 207 (2004) 161
  

学会発表

• 加川友己, 松浦勝久, 清水達也, 常田聡, 岡野光夫 (O)
  局所酸素濃度計測による心筋細胞の機能評価
  第17回酸素ダイナミクス研究会（弘前大学）2013年8月4日
  

• Satoshi Tsuneda, Yuki Kagawa, Naohiro Kishida, Shinya Matsumoto, Cristian Picioreanu, Mark C.M. van Loosdrecht (O)
  Mathematical modeling for the nutrient removal process with growth of microbial granules
  5th Quadrennial IWA Specialty Conference on Microbial Ecology and Water Engineering, (University of Michigan, Ann Arbor, MI USA) July 8, 2013
  

• 加川友己, 前山絵里奈, 関根佳織, 太田裕貴, 松浦勝久, 清水達也, 常田聡, 岡野光夫 (O)
  ラットおよびヒトiPS細胞由来心筋細胞の局所酸素濃度に応じた代謝動態
  第12回日本再生医療学会総会（パシフィコ横浜）2013年3月23日
  

• 前山絵里奈, 加川友己, 関根佳織, 太田裕貴, 松浦勝久, 清水達也, 常田聡, 岡野光夫 (P)
  心臓を構成する各種細胞の酸素消費速度の測定
  第12回日本再生医療学会総会（パシフィコ横浜）2013年3月21日
  

• 加川友己, 坂口勝久, 関根秀一, 清水達也, 常田聡, 岡野光夫 (O)
  心筋細胞シートにおけるエネルギー代謝
  第16回酸素ダイナミクス研究会（島津製作所東京支社イベントホール）2012年9月29日
  

• 前山絵里奈, 加川友己, 関根佳織, 関根和希, 清水達也, 常田聡, 岡野光夫 (O)
  単層培養系における局所酸素濃度の測定
  第16回酸素ダイナミクス研究会（島津製作所東京支社イベントホール）2012年9月29日
  

• Yuki Kagawa, Erina Maeyama, Tatsuya Shimizu, Satoshi Tsuneda, Teruo Okano (P)
  Metabolic change of cultured cell sheets depending on oxygen supply
  3rd TERMIS World Congress 2012 (Vienna, Austria) September 5-8, 2012.
  

• Erina Maeyama, Yuki Kagawa, Tatsuya Shimizu, Satoshi Tsuneda, Teruo Okano (P)
  Measuring energy metabolism of cell sheets used for tissue engineering
  The 2nd international symposium of materials on regenerative medicine (Taipei Medical University, Taipei, Taiwan) August 31, 2012.
  

• 加川友己, 前山絵里奈, 関根和希, 坂口勝久, 関根秀一, 清水達也, 常田聡, 岡野光夫 (O)
  培地・酸素供給の変化に応じた細胞シートの代謝変動特性
  第11回日本再生医療学会総会（パシフィコ横浜）2012年6月12日
  

• 加川友己, 田中裕也, 坂口勝久, 関根秀一, 清水達也, 常田聡, 岡野光夫 (O)
  細胞シート積層による三次元心筋組織構築過程における代謝評価
  日本組織培養学会 第85回大会（京都大学）2012年5月17日
  

• 前山絵里奈, 加川友己, 関根和希, 清水達也, 常田聡, 岡野光夫 (O)
  再生医療に用いる細胞シートのエネルギー代謝
  日本組織培養学会 第85回大会（京都大学）2012年5月17日
  

• 加川友己, 前山絵里奈, 関根和希, 坂口勝久, 関根秀一, 清水達也, 常田聡, 岡野光夫 (O)
  単層細胞シートの代謝評価と酸素供給の影響
  化学工学会 第77年会（工学院大学）2012年3月15日
  

• Yuki Kagawa, Yuya Tanaka, Katsuhisa Sakaguchi, Hidekazu Sekine, Tatsuya Shimizu, Satoshi Tsuneda, Teruo Okano (P)
  A Feasibility Study on Monitoring the State of Culturing Myocardial Tissues by the Glucose Metabolism Measurement
  TERMIS-NA 2011 (Houston, TX, USA) December 13, 2011.
  

• 加川 友己, 関根 秀一, 清水 達也, 常田 聡, 岡野 光夫 (P)
  新生仔ラット心筋細胞シートにおける内皮細胞の動態イメージング
  第20回バイオイメージング学会学術集会（千歳科学技術大学）2011年9月2日
  

• 常田 聡, 加川 友己, 田畑 潤也, 岸田 直裕, 松本 慎也, 青井 議輝, C. Picioreanu, M. C. M. van Loosdrecht
  微生物グラニュールによる窒素・リン同時除去プロセスの解明：実験と数理モデリング
  化学工学会第76年会 （東京農工大学 小金井キャンパス）2011年3月22-24日
  （※震災の影響により中止）
  

• 加川 友己, 谷口 英樹, 常田 聡 (P)
  腸陰窩モデルによる細胞増殖分化シナリオの検証
  定量生物学の会 第3回年会（東京大学 生産技術研究所）2010年11月27-28日
  

• Y. Kagawa, J. Tahata, N. Kishida, S. Matsumoto, Y. Aoi, S. Tsuneda, C. Picioreanu, and M.C.M. van Loosdrecht. (P)
  Development of a computational model for the growth process of aerobicgranular sludge
  （好気性グラニュール成長過程のシミュレーションモデル構築）
  第26回日本微生物生態学会大会 バイオフィルム研究部会（筑波大学）2010年11月24日
  

• 加川友己，谷口英樹，常田聡 (O)
  ヒト大腸陰窩における分裂細胞空間配置パターンのダイナミクス
  日本物理学会第65回年次大会 (岡山大学）2010年3月20日
  

• 加川友己，田畑潤也，岸田直裕，松本慎也，青井議輝，常田聡，C. Picioreanu，M. C. M. van Loosdrecht (O)
  好気性グラニュールにおける微生物生態構造:数理モデル構築とシミュレーション
  第44回日本水環境学会年会 (福岡大学）2010年3月15日
  

• 加川友己，谷口英樹，常田聡 (P)
  腸陰窩における細胞配置のダイナミクス
  定量生物学の会 第2回年会 (大阪大学）2010年1月10-11日
  

• Y. Kagawa, N. Horita, S. Matsumoto, H. Taniguchi, and S. Tsuneda (O)
  "Cell proliferation and differentiation in the intestinal crypt using an individual-based model"
  （個体ベースモデルを用いた腸管陰窩における細胞増殖分化のシミュレーション）
  第19回日本数理生物学会大会（東京大学）2009年9月10日
  

• Y. Kagawa, S. Matsumoto, J. Tahata, N. Kishida, Y. Aoi, S. Tsuneda, C. Picioreanu, and M.C.M. van Loosdrecht (P)
  "Microscopic and macroscopic models for aerobic granular sludge processes"
  Specialised Conference on Microbial Population Dynamics in Biological Wastewater Treatment (ASPD5), (Aalborg Congress & Culture Centre, Aalborg, Denmark) May 27, 2009.
  

• 加川友己，堀田徳子，松本慎也，谷口英樹，常田聡 (O)
  腸管上皮における細胞増殖・分化過程の数理モデリング
  日本物理学会第64回年次大会 (立教大学）2009年3月30日
  

• 加川友己，田畑潤也，岸田直裕，松本慎也，青井議輝，常田聡，C. Picioreanu，M. C. M. van Loosdrecht (O)
  好気性グラニュールを用いた窒素・リン同時除去プロセスの数理モデリングとシミュレーション
  第43回日本水環境学会年会 (山口大学）2009年3月18日
  

• 堀田徳子，松本慎也，加川友己，谷口英樹，常田聡 (O)
  結腸陰窩における細胞増殖分化の時空間ダイナミクス
  第５回「生物数学の理論とその応用」（京都大学）2009年1月16日
  

• 堀田徳子，松本慎也，加川友己，谷口英樹，常田聡 (P)
  結腸陰窩における細胞増殖分化のシミュレータ開発及び実験データとの定量比較
  定量生物学の会　第１回年会 (東京大学) 2009年1月11日
  

• 加川友己，田畑潤也，岸田直裕，松本慎也，青井議輝，常田聡，C. Picioreanu，M. C. M. van Loosdrecht（P)
  バクテリアによる自己造粒体（グラニュール）形成過程のマルチスケールモデリング
  定量生物学の会　第１回年会 (東京大学) 2009年1月11日
  

• 加川友己, 伊藤昌明, 高松敦子 　（O）
  重み付き2次元ネットワーク上の結合振動子系のダイナミクス
  日本物理学会第63回年次大会（近畿大学）2008年3月25日
  

• 加川友己, 伊藤昌明, 高松敦子 　（P）
  真正粘菌変形体の結合力学系モデルとそのダイナミクス
  第3回移動知シンポジウム（宮城県松島）2008年3月7日
  

• 加川友己, 伊藤昌明, 高松敦子 　（O）
  重み付き2次元ネットワーク上の結合力学系における協同現象　〜真正粘菌変形体の適応行動発現の解明にむけて〜
  第20回自律分散システム・シンポジウム（長野県諏訪市）2008年1月25日
  

• Yuki Kagawa, Masateru Ito and Atsuko Takamatsu 　（P）
  Synchronization in two-dimentional organism modeled with coupled maps on weighted trees
  European Conference on Complex Systems '07 (University of Technology Dresden, Dresden, Germany) Oct 1, 2007.

• 加川友己, 伊藤昌明, 高松敦子 　（O）
  重み付き2次元ネットワーク上の結合写像系における同期
  日本物理学会第62回年次大会（北海道大学）2007年9月21日

• Atsuko Takamatsu, Masateru Ito and Yuki Kagawa　（P）
  Network geometry analysis in plasmodial slime mold.
  2nd International Symposium on Mobiligence. (The Awaji Yumebutai Int. Conf. Center, Awaji, Japan) July 20, 2007.
  

• Yuki Kagawa　（P）
  Distribution of bead displacements in optical-trap single molecule experiments on muscle myosins.
  5th East Asian Biophysics Symposium & 44th Annual Meetings of the Biophysical Society of Japan. (Okinawa Convention Center, Okinawa, Japan) Nov 13-14, 2006.

• Yuki Kagawa　（O）
  Stochasticity of the step size and its effect on the actin-myosin sliding motion.
  Physics of Molecular Machines: Joining theory and experiments. (Ecole de Physique des Houches, Les Houches, France) May 25, 2006.

• 加川友己　（P）
  ステップサイズゆらぎによるアクチン-ミオシン滑り運動の高速化
  日本物理学会第61回年次大会（愛媛大学・松山大学）2006年3月28日

• 加川友己　（P）
  アクチン-ミオシン滑り運動におけるステップサイズゆらぎの影響
  日本生物物理学会第43回年会（札幌コンベンションセンター）2005年10月25日

• Yuki Kagawa, Timothy L. Megraw and Rudolf Oldenbourg　（P）
  Dynamics of cell division without functional mitotic centrosomes.
  The American Society for Cell Biology 44th Annual Meeting at Washington Convention Center (Washington, DC) December 6, 2004

• Yuki Kagawa, Timothy L. Megraw and Rudolf Oldenbourg　（O）
  Dynamics of cell division without functional mitotic centrosomes.
  General Scientific Meeting at Marine Biological Laboratory (Woods Hole, MA) August 10, 2004

• 加川友己，橋本哲平，槌屋嘉実 　（O）
  車軸藻内微小顆粒によるアクチンミオシン滑り運動のゆらぎ解析
  日本生物物理学会第３８回年会（東北大学）2000年9月13日

• 加川友己，橋本哲平，槌屋嘉実　（P）
  車軸藻内微小顆粒によるアクチンミオシン滑り運動の高時間分解能解析
  日本物理学会2000年春の分科会（関西大学）2000年3月25日

• 加川友己，槌屋嘉実 　（P）
  ミオシン１分子による滑り力発生過程
  日本物理学会第５４回年会（広島大学）1999年3月30日

• 加川友己，新田一功，水上裕紀，内田豪，槌屋嘉実 　（O）
  車軸藻再構成系における分子摩擦
  日本生物物理学会第３６回年会（九州大学）1998年10月2日

• 加川友己，水上裕紀，内田豪，槌屋嘉実 　（O）
  車軸藻モータータンパク質の滑り運動に伴う分子間摩擦の評価
  日本物理学会1997年秋の分科会（神戸大学）1997年10月8日

その他の発表

• 加川友己
  数理モデルの生命科学研究への適用　ー可能性と限界ー
  2009年度 バイオフィルムと複合系研究会
  （早稲田大学軽井沢セミナーハウス）2009年10月11日

• Yuki Kagawa
  Actin-myosin dynamics of organelle motion in a characean internodal cell.
  Cell Seminar Series (June 9, 2004 at Marine Biological Laboratory)

• 加川友己
  車軸藻内微小顆粒によるアクチン・ミオシン滑り運動と運動モデル
  「非平衡反応場におけるベクトル生成と変換システム」第3回研究会
  （お茶の水女子大学）2001年1月27日

• 加川友己
  車軸藻内微小顆粒によるアクチンミオシン滑り運動のゆらぎ解析
  第40回生物物理若手の会夏の学校ポスター交流会（東京大学）2000年8月2日