kahoの日記： STAP細胞の非実在について＃２ 4
前回の日記は思いの外反響があり，驚いています．
察していただいた方もいらっしゃった通り，私は件の論文に直接関わる立場ではないのですが，研究所の外から見れば「中の人」になります．
内部では実名でこのような活動をしており，隠れているつもりはありません．内部でどうしても解決できなかった場合は外へ向けて情報を出すでしょうが，それまではできるだけ内部での解決を目指しています．
その目的は迅速な論文の撤回とできる限りの真相の解明がなされることであり，また動機は科学への信頼，研究所への信頼の棄損を許せないことが半分，この状態を曖昧にしておくことで私個人の研究活動も制限を受けかねないのでそれを防ぎたいという私利私欲も半分の動機となります．
科学的な事実を争う立場としては私は間違っていないという自信がありますが，政治的に勝利できるかどうかは全く分かりません．
更にいくつかの証拠をここに書こうと思いましたが，今回の論文の著者らに手の内を知らせずに２の矢３の矢を放たなければならない状況になってきましたので，解析結果をここに書くのは彼らにそれらを突きつけてからという順番になりそうです．
前回の日記で述べた"input"の比較データについては下記のアドレスから閲覧できるようにしました．ここには図を貼れないので，UCSC Genome Browserの力を借ります．
同じデータは公開データを使うことでどなたにも作成できるはずです．
TCR-beta
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?hgS_doOtherUser=submit&hgS_otherUserName=stopstap&hgS_otherUserSessionName=TCR%20beta%20rearrangement%20test
TCR-alpha
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?hgS_doOtherUser=submit&hgS_otherUserName=stopstap&hgS_otherUserSessionName=TCR%20alpha%20rearrangement%20test
また，おまけをつけておきます．これが何を意味するかはいずれわかると思います．
chrX
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?hgS_doOtherUser=submit&hgS_otherUserName=stopstap&hgS_otherUserSessionName=Appendix
応援しています (スコア:0)
何の役にも立たないコメントで申し訳ないのですが，同じ研究者（情報系）として応援しています．
先の日記を読むと，妙なバッシングをする人がいるようですが，がんばってください．
理研の他の研究所は今回の対応をどう思っているのでしょうか・・・
、、、え？ (スコア:0)
これ、使われてる細胞の性別が違うってことね。。。
酸処理で性転換が起こった？
事はもっとシリアス？？ (スコア:0)
kahoさん、ありがとうございます。論文にでてくるCD45+細胞は酸処理で性転換を起こした。好意的に見ると。。。
悪意を持ってみるとSTAP幹細胞を作って行く各段階の細胞が違う個体（幹細胞と酸処理したものは雄、なるほど、雄の方がSTAPができ易いからね、でも酸処理前のCD45+として表示されている細胞集団は雌からとられたものってことね。）から派生した、データに一貫性が無いという事ですね。
さすがにGFPは持ってるんだろうね。
ESCとSTAP-SC (スコア:0)
こんにちは。おはようございますか？上の人が指摘している以上に、、、
これ、論文で比較されているESCとSTAP-SCも性別が違うってこと？
なら、転写解析結果もある程度、違って当たり前では無いの？性差を見ている可能性があるだろうから。
ESで性差がどれくらいあるのか知らないけど。