西暦2014年。C県X市…巨大コングロマリットEXE社の企業城下町において、怪人マイナモッドによる事件を追う女性刑事：竹田鶴たけだつるは、ある現場において余市よいちという名の男性を助ける。彼は、自らの名以外は何も思い出せない。

一方で、怪人の出現する現場に出没する謎の女性、響ひびき。彼女は彼女で、マイナモッドの行動を探っていた。彼女は余市を知っており、余市の存在を遠巻きに見張っていた。

余市は、自らの記憶を取り出すため、鶴の力を借りつつマイナモッドの事件を追い始める。
そして余市は、自らが発見された現場でマイナモッドに遭遇する。その際に、余市の頭に声が響く…「変身しろ。」
頭に響く声に従い、余市はUMDとクロスイコーラーを起動させる。元からその2つの道具について知っているかのように。
そして余市は、仮面ライダークロスとして、マイナモッドに立ち向かう。

仮面ライダー SF 現代 記憶喪失