シリアルATA　認識せず??

該当のM/Bを使ってないので一般的にことしか書けませんが

まずBIOSでS-ATAがどうなっているか確認して下さい。
私の場合では、IDE(PATA)とS-ATAをどう使うかはBIOSの設定が必要でした。
S-ATAを使っていない場合は、S-ATAを認識しない設定になっているので(PATA Only)これをS-ATAとIDEが両方使えるように設定(正確にはどう認識させるかの設定、起動順番等)にしないといけません。
またSilicon Imageの方も、BIOSで無効になっていると使えません。
私の使っているBIOSはAMIですが、Integrated Peripheralsの中に
ATA/IDE Configuration の Configurations SATA as で IDEとかRAIDとかの切り替えがあり、さらに PATA Only とか PARA Pri, SATA Secなど細かい設定があります。
私も最初はここがPATA Only(SATAを使わない)になっていて悩んだ記憶があります。
一度、付属マニュアルのBIOSの項を読まれることをお勧めいたします。

ドライバーも認識しているようなら、コントロールパネルのコンピュータの管理ツールでパーティションの設定とドライブ番号の設定、フォーマットをしてやれば、マイコンピュータの中にドライブが現れると思います。

問題点を整理したほうが良さそうです。

まず、どちら側のRAIDコントローラを使おうとしているのか今ひとつわかりません。
A8N-SLI Deluxeには、NVIDIA® nForce 4 SLI RAIDコントローラと
Silicon Image 3114R SATA RAID コントローラの２種類が搭載されています。
基本的に互換性はないと思うので、どちらかで作ったアレイは他方では認識しません。

BIOSで見えるのは、
NVIDIA® nForce 4 SLI RAIDコントローラに接続した方だと思いますが、
認識させるには、XPの場合、NVIDIA RAID Class Driver 又は NVIDIA NForce Storage ControllerのRAIDドライバーをインストールしないといけません。
(わからなければ両方入れてください。)
ドライバーを入れなければ当然のことながら、BIOS上では認識してもWindows XP上では、HDDを認識しません。

一方Silicon Image 3114R SATA RAID コントローラの方は
ファームウェアの制限があり、Silicon Image RAID configuration Utilityで SATA を JBOD (single) モードに しないと、シングル SATA HDDが使えないそうです。
RAID BIOS 側で JBOD モードの Array を作成した上でドライバーをインストールして下さい。

RAID BIOS 側で JBOD モードの Array を作成してますか？

BIOSで見えるのならXPのドライバが正常に組み込まれていないと思います。
SiliconImageかASUSら最新のドライバを落としてきてインストールしてみるのは如何でしょうか？

また、SiliconImageのデバイスはデバイスマネージャでSCSI/RAIDコントローラとして認識されていた様な気がします。
デバイスマネージャのSCSIかIDE ATAPIの項目に？か×の付いたものが無いかどうか、あとイベントビューワでエラーが無いかどうかをチェックしてみてください。
（マイコンピュータを右クリック＞管理、で両方見れます）