スカイリムは、二次創作になってしまうらしいです。

素直です。原体験がゲームから書かれた小説は普通にありますのでそれ自体は問題ありません。

本当にモチーフで書きたいのならば手を抜かず徹底して頑張るべきです。ゲームを元にお話を書く場合、大抵オリジナルを書くぐらい肉付けする事になるので勿体無いですよ。
現時点の問題点はタイトルと地名がそのまますぎるだけですので。だからって名前だけ改変じゃだめですけど。

　最初に釣りをなさる方ではないという前提の元書かせて頂きます。
　お話を書くには使うべきではない単語というものがあります。ファンタジーで一例を挙げればホビットが相当します。疑問に感じるでしょうか？
　ホビットという種族は『伝承に存在しないトールキンの創作』です。その為エルフやドワーフと違ってお話を書く人々は別の表現を当てています。
　読者の側で考えるとＳＦを読み始めたらガンダムと宇宙世紀世界がそのままでてくる位の違和感があります。読者として納得できますか？　まず受け入れられないですし、パロディでも伏字ぐらいにはしますよね。
　Dragonbornはそれに当たります。竜騎士などとは違うのです。

　単語や設定の流用も汎用な設定として通用するレベルに纏めなければなりません。オリジナルで書くより大変かもしれませんが、どこまでオリジナルとして成り立たせられるかで評価は一変すると思います。

　なお、二次創作の問題は基本的に対応に当たるのが本人だけではなくサイトが行わなければならず、運営がとても管理しきれないかったからという理由もあります。
　検索すればファンフィクションとかごろごろしているタイプの海外作品でもこの場所での公開は控えるのが無難と思っています。二次創作公開の許可を個別に得ていても対応しきれないと書いてありましたからね。現時点でベセスダから掲載可能との返答はないようです。

　悪文でうまく伝えられたのか自信がないのですが今後の活躍をお祈りします。もし正式に許可がでたら思う存分やってください！