あの実験失敗の日から心を閉ざし、自分の息子のシンジすら遠ざけて来た碇ゲンドウ。しかし使徒の襲来間際になり、ゲンドウは使徒に勝つために背に腹は代えられず、シンジをパイロットに召集する。成り行きでパイロットになったシンジに、ゲンドウは冷たい態度をとっていた。
だが実験の真相が明らかになると、ゲンドウの信念は揺らぎ、苦悩してしまう。ゲンドウに失望していたシンジだが、父の苦しみを知り再び立ち上がる。
※シンジとゲンドウがメインですが、LASもあります。
※完結後、予告通り短編を少しだけ（２～３話分位）不定期に更新する予定です。

第一話　碇ゲンドウの憂鬱	2011年 09月19日 23時
第二話　葛城ミサトの憂鬱	2011年 09月22日 23時
第三話　綾波レイの憂鬱	2011年 09月23日 18時
第四話　惣流アスカの憂鬱	2011年 09月24日 23時
第五話　碇シンジの憂鬱	2011年 09月25日 23時
第六話　碇シンジの奮起	2011年 09月27日 23時
第七話　碇ゲンドウの奮起	2011年 09月28日 23時
第八話　惣流アスカの奮起　～Mother knows～	2011年 10月01日 19時
第九話　綾波レイの奮起　～神の贈り物～	2011年 10月03日 23時
第十話　葛城ミサトの奮起　～ミッション・ポッシブル～	2011年 10月07日 23時
番外編　第一話　背水の告白　～シンジ、ドイツへ飛ぶ～	2011年 10月09日 23時
後書き