不正の疑いがもたれたきっかけは、外国の麻酔学に関する学術誌に２月、英国の専門家が投稿した藤井医師の論文に関する評論。１９９１〜２０１１年に藤井医師が実施したとしている約１７０件の試験データを統計学的に分析した結果、試験対象者の年齢、体格、血圧などの傾向が特定の範囲に集中し、平均的な分布と大きく異なって、本来あるはずのばらつきがなかった。評論は、こうしたことはほぼありえないとしてデータの正しさに疑問を呈するなど、複数の専門誌がデータ捏造（ねつぞう）や改ざんを示唆した。

　これを受け、藤井医師の論文を掲載した国内外の２３の専門誌が４月、藤井医師が過去に在籍した病院や研究機関に対し、論文の撤回を検討している旨の書面を送付。各機関でも調査するよう求めた。

　調査対象の１９３本のうち９本は、藤井医師が東邦大在籍中に発表。同大が調査した結果、いずれも藤井医師が茨城県内の病院で行った、患者を対象とした研究を基にしていたが、実施前に義務づけられている病院内の倫理委員会の承認を得ていたのは１本だけだった。藤井医師が事実関係を認め論文を撤回したとして、同大は２月２９日付で藤井医師を諭旨退職処分にした。