序盤：序盤では、本当に回復薬が重宝します。なので、パーティーに最低1匹はホイミなどの回復が使えるように、サンドロ島に出てくるホイミスライムやキメラのスキル、ＨＰかいふくやいじょうかいふくなどを、積極的に取り入れるために、この2匹と配合をしましょう。
中盤：この辺からは、強いモンスターが出てくるので、その高いランクのモンスターと配合していくと、より強いランクのモンスターが出来上がるでしょう。神獣も積極的に配合していきましょう。同じモンスターになりますが、特技も継承できて、オススメです。
終盤：終盤は、全体回復が重宝します。全体回復のスキルは、ノビス島の南西のヘルコンドルをスカウトし、配合させましょう。ベホマラーやスクルトで仲間の援護役になれます。また、ＡＩ2回行動のモンスターをつくりましょう。まおうのつかいなどがそうです。また、神獣もどんどん配合して、いろいろなスキルを継承しましょう。
最終的なオススメ配合
シドー：まおうのつかい+うごくせきぞうなど
ゾーマ：ワイトキング(キングスライム+なげきのぼうれい)+シドー
ミルドラース：シドー+ギガントドラゴン(ギガントヒルズ+バズズ)
配合で強いモンスターを作るのは、ＤＱＭの醍醐味ですよね！！！
では、どうすれば今作で、強いモンスターを作れるのかといいますと、今回はモンスターにランクがついています。なので、ランクの高いモンスターと配合してやると、簡単に強いモンスターを作ることが可能です。
ストーリー中の島では、大体の最高ランクは、ノビス島のギガンテスやモルボンバ島のフラワーゾンビといったところでしょうか。そいつらと、配合してやると、上級のモンスターを作れます。
また、配合時に3種族のモンスターを選べますが、このとき、ＵＰと書いてある場合、配合する前のモンスターのランクよりも、高いランクのモンスターが生まれます。これを利用して配合をジャンジャンやってみてください。
