東京都立クロマティ高校、そこは選りすぐりの不良達が揃う、「ワルのメジャーリーグ」とも言われるほど恐れられている高校である。
主人公・神山高志は優等生ながらも、中学時代に助けてもらった親友と同じ高校に行くため引き算ができれば入学できる（しかも面接がない）というクロマティ高校を受験したのであったが、なんとその親友は不合格となってしまったため、結局神山1人が入学してしまう。それでも挫けず通っている内に、究極のバカ・林田慎二郎や影の薄い前田彰、茶筒型のロボット番長メカ沢新一や、高校生どころか日本人にすら見えないフレディ、それどころか明らかに本物のゴリラであるゴリラ（豪ヒロミ）、喧嘩は強いが乗り物に弱い竹之内豊、大財閥の息子・北斗武士と名前を名乗ろうにも必ず妨害が入るため名前を名乗れない子分など、クセの強い友人や仲間が増えてゆき、この異常な学校にも馴染んでいくのだった…。
魁!! クロマティ高校 声優神山高志（かみやま たかし）声：櫻井孝宏
林田慎二郎（はやしだ しんじろう）声：鈴木琢磨
前田彰（まえだ あきら）声：稲田徹
メカ沢新一（メカざわ しんいち）声：若本規夫
竹之内豊（たけのうち ゆたか）声：内藤玲
マスクド竹之内（マスクド たけのうち）声：黒田崇矢
北斗武士（ほくと たけし）声：森訓久
