シナリオチャート
地球が消えた日(前半・後半)
↓
研究員たちの脱出を支援する
(リガ・ミリティアルート)		 遺跡内に突入し、救助に向かう
(ネオ・ジオンルート)
↓ ↓
閉ざされた世界で 惑乱の宇宙で
↓ ↓
激震の大地！真ドラゴン復活！！ 最悪な来訪者
↓ ↓
悪夢！インベーダー早乙女！ 刻の涙は止まることなく
↓ ↓
飛ばせ鉄拳！ダブルマジンガー オレの歌を聴け！
↓ ↓
戦禍の中で立ち上がれ！ 少年たちは戦場に帰る
↓ ↓
Mr.ネゴシエイター(前半・後半) 戦う女市長 エースのミリア！(前半・後半)
↓ ↓
憎しみは激闘の中 蒼き人類のゆりかご
↓ ↓
陽光下の戦い ↓
↓ ↓
結成　特殊独立戦隊
↓
プリティデビル
↓
その名は"破滅"
↓
恐怖の宇宙病　ベムボーグを捕獲せよ
↓
男主人公ルート 女主人公ルート
↓ ↓
アイスドール　グラキエース 運命の風
↓ ↓
降臨！南海を断つ邪神！！(前半)
↓
降臨！南海を断つ邪神！！(後半)
↓
強襲！ギシン星間帝国ベガ艦隊
↓
木星へ向かう
(木星ルート)		 カイラスギリー攻略作戦に参加する
(カイラスギリールート)
↓ ↓
ジュピター・ミラージュ(前半・後半) 対決！マーズとマーグ(前半・後半)
↓ ↓
↓ カイラスギリー攻略戦
↓ ↓
背中ごしのセンチメンタル(前半・後半)
↓
アナザー・アースより来たるもの
↓
銀河の虎
↓
PLANET DANCE
↓
ザール艦隊総司令官クロッペンの挑戦！
↓
壮絶！巨大ローラー作戦！
↓
聞こえないレクイエム
↓
生と死の呪縛
↓
男主人公ルート 女主人公ルート
↓ ↓
響きあう魂の行方(前半) 私に、さよならを(前半)
↓ ↓
響きあう魂の行方(後半) 私に、さよならを(後半)
↓ ↓
誇り高き反逆者
↓
戦場の父、戦場の子(前半)
↓
戦場の父、戦場の子(後半)
↓
旧エリオス領へ行く
(旧エリオスルート)		 エンジェル・ハイロゥ攻略
(エンジェル・ハイロゥルート)
↓ ↓
暴かれた真実(前半) 幻覚と踊れ(前半)
↓ ↓
暴かれた真実(後半) 幻覚と踊れ(後半)
↓ ↓
反逆のクロッペン(前半) 狂乱のエンジェル・ハイロゥ(前半)
↓ ↓
反逆のクロッペン(後半) 狂乱のエンジェル・ハイロゥ(後半)
↓ ↓
暗黒の皇帝
↓
ギシン星間帝国へ向かう
(ギシン星間帝国ルート)		 惑星ラクスへ向かう
(惑星ラクスルート)
↓ ↓
反乱惑星の対決！ 禁断惑星のシビル(前半)
↓ ↓
卑劣な皇帝ズール(前半) 禁断惑星のシビル(後半)
↓ ↓
卑劣な皇帝ズール(後半) 決死の防衛
↓ ↓
死闘！ギシン星最終決戦！(前半) 悪夢の突入作戦(前半)
↓ ↓
死闘！ギシン星最終決戦！(後半) 悪夢の突入作戦(後半)
↓ ↓
↓ 響け銀河に　オレたちの歌
↓ ↓
"破滅の意味"
↓
クライシス・ポイント(前半)
↓
クライシス・ポイント(後半)
↓
デザイア(前半)
↓
デザイア(後半)　(最終話)
エピローグ
(リガ・ミリティアルート)		 エピローグ
(ネオ・ジオンルート)
↓ ↓
主人公・パートナー　エンディング