8個目のバッジゲットのため、ナギサシティへと向かうサトシたちは森の中で道に迷っていた。すると突然、すさまじい地響きとともに"はんこつポケモン"ギラティナが現れ、サトシたちに襲いかかってきた!なんとか逃げ切り胸をなでおろしたのもつかの間、今度は前から猛烈な勢いの鉄砲水が!流れにのみ込まれ、もがき苦しむサトシたち!だが、このハプニング、実は"くらやみポケモン"ヤミカラスが見せていた幻だったのだ!それを教えてくれたのは"よなきポケモン "ムウマを連れた女性。しかもどうやら幻を見せていたヤミカラスとは深い関係があるらしい・・・。これって一体どういうこと!?