古事記は、創造神が生まれた物語の次に、伊耶那岐神（いざなきのかみ）と伊耶那美神（いざなみのかみ）による「国生み」と「神生み」の物語に移ります。

高天原に住む神々は、「神代七代」（かみのよななよ）のうち、一番最後に生まれた伊耶那岐神と伊耶那美神に、下界の海を指し示し、
「漂っている国を固めよ！」
と命じ、美しい飾りのある「天の沼矛」（あめのぬほこ）を渡しました。
　伊耶那岐神と伊耶那美神は、天空にある「天の浮橋」（あめのうきはし）に立って海に矛を下ろし、海水を「こをろ、こをろ」とかき回しました。
　矛を引き上げると、その先から海水がしたたり落ち、塩が固まって島ができました。これが淤能碁呂島（おのごろしま）です。
　その後、二柱の神はこの島を拠点に、次々と島を生んでいくことになります。

伊耶那岐神と伊耶那美神は島に降り立ち、高天原の神々と心を通じ合わせるために、天の御柱（あめのみはしら）を立て、つづけて、大きな神殿の八尋殿（やひろどの）を建てました。
一息ついたところで、伊耶那岐神は、自分の下半身に何か不思議なものがぶらさがっているのに気付き、
「あなたの体はどのようになっているか」
と尋ねました。
　すると、伊耶那美神は、
「私の体は既にできあがっているのですが、一ヶ所だけ何か足りずに、くぼんでいるところがあります。」
と答えたので、伊耶那岐神は、
「私の体も既にできあがっているのですが、一ヶ所だけ何か余って、でっぱっているところがあります。それでは、私のでっぱっているものを、あなたのくぼんでいる穴に挿し入れて、塞いで、国を生もうと思います。」
というと、伊耶那美神はこれに賛成しました。そして、天の御柱で神に祈りを捧げてから、国を生むことにしました。

　伊耶那岐神は左から、また伊耶那美神は右から天の御柱をまわり、出会ったところで、伊耶那美神が、
あなたは、なんていい男なんでしょう！」
つづけて、伊耶那岐神が
「あなたは、なんていい女なんだろう！」
といいました。言葉には力があるといわれます。よい言葉を話すと幸せになり、わるい言葉を話すと不幸になるので、二人は国を生むにあたり、お互いを褒める言葉を交わしたのです。
　そして、二神は神殿の寝室で、美斗能麻具波比（みとのまぐはひ）をしました。「まぐはひ」とは、夫婦の交わりのことです。
　しかし、生まれてきたのは手足のない水蛙子（ひるこ）でした。ふたりは悲しみながら、その子を葦の船にいれて流しました。
　ところが、次に生まれたのも、淡島（あわしま）で、泡のようなできそこないの島でした。

　二神は相談して高天原に帰り、神々に相談をします。すると占いにより、女から先に声をかけたのがいけなかったことがわかりました。
　さっそく二神は淤能碁呂島に戻り、天の御柱を回って、今度は伊耶那岐神から先に、
「あなたは、なんていい女なんだろう！」
伊耶那美神がつづけて
「あなたは、なんていい男なんでしょう！」
といい、ふたたび交わりました。
　そうすると、どんどん立派な国が生まれました。
　一番初めに生まれた島は、淡路島（あわじしま）。つづけて四国、隠岐島（おきのしま）、九州、壱岐島（いきのしま）、対馬（つしま）、佐渡島（さどがしま）、そして本州が生まれました。これら八つの島を、「大八島」（おおやしま）といいます。
　二神は、つづけて、児島（こじま）、小豆島（あずきしま）、大島、姫島、五島、両児島（ふたごしま）の六つの島を生み、「国生み」を終えました。これで日本の国土が完成したのです。

　次に、伊耶那岐神と伊耶那美神は、大八島に住むべき神々を生んでいきます。
　始めに生まれたのは、住居にかかわる七柱の神。
つづけて、海の神、河の神など、水にかかわる三柱の神。
そして、風の神、木の神、山の神、野の神、の大地にかかわる四柱の神。
最後に、船の神、食べ物の神、火の神、の生産にかかわる三柱の神、合わせて十七柱の神が生まれました。
またその途中で、河の神が泡、波、水面など、河に関する八柱の神を生み、また山の神と野の神が交わり、山頂、霧、渓谷など、山に関する八柱の神を生みました。これら十六柱の神は、伊耶那岐神と伊耶那美神の孫に当たります。

しかし、ここで悲しいできごとがありました。
火の神である火之迦具土神（ひのかぐつちのかみ）が生まれるとき、伊耶那美神は陰部にやけどを負ってしまいます。
伊耶那美神は病床で苦しむのですが、苦しみながらも「神生み」は続きます。伊耶那美神は病床で、嘔吐し、糞尿を垂れ流すのですが、吐いたゲロからは鉱山の神二柱、ウンコからは土の神二柱、そしてオシッコからは灌漑の神、生成の神が生まれました。
また、生成の神は後に、穀物の神である豊宇気毘売神（とようけびめのかみ）を生みます。
ところで、豊宇気毘売神は、のちに、天照大神（あまてらすおおみかみ）の食事をつかさどる神として、神宮の外宮（げくう）に祀られることになる、極めて重要な神様です。

そして、伊耶那岐神の懸命な看病のかいもなく、伊耶那美神は命を落とします。伊耶那岐神は涙を流して泣きました。するとその涙から、泣沢女神（なきさはめのかみ）が生まれました。
伊耶那岐神は、伊耶那美神の亡骸を、出雲国（いづものくに）（島根県）と伯伎国（ははきのくに）（鳥取県）の境にある比婆之山（ひばのやま）に葬りました。
伊邪那岐神の悲しみはつのるばかりでした。ついに腰に帯びていた十拳剣（とつかのつるぎ）を抜いて、生まれたばかりの、火之迦具土神の首を斬ってしまいました。
そこから先は、古事記第3話をおたのしみに。