昔、この動画の抜けている部分だけを書いたのですが、いい機会なので
動画で紹介しているものも含めて載せます。
動画自体も元ネタの戦艦の画像とかあって楽しいですよ。
碇シンジ
苗字の由来は船の錨と
大学時代の友人で広告デザイナーの碇義彦から。
名のシンジは庵野の友人で『ふしぎの海のナディア』の監督を務めた
樋口真嗣から
綾波レイ
大日本帝國海軍特型駆逐艦II型一番艦「綾波」から。
名の「レイ」は『セーラームーン』の登場人物「火野レイ」からで、
また「零（れい）」との掛詞でもある。
惣流・アスカ・ラングレー
大日本帝国海軍航空母艦「蒼龍（そうりゅう）」とアメリカ合衆国海軍航空母艦
ラングレイ(CV-1)、ラングレー(CVL-27)
名の「アスカ」は漫画『超少女明日香』（著：和田慎二）の主人公
「砂姫明日香」から。
惣流・キョウコ・ツェッペリン
「キョウコ」は漫画『超少女明日香』（著：和田慎二）の登場人物
「葵今日子」から。
葛城ミサト
大日本帝国海軍雲龍型航空母艦三番艦「葛城」
名の「ミサト」は漫画『あいつ』（著:成田美名子）の登場人物「泉みさと」から。
赤木リツコ
大日本帝国海軍航空母艦「赤城（あかぎ）」と
名の「リツコ」は庵野秀明の中学時代の友人から。
赤木ナオコ
名の「ナオコ」は庵野秀明の小学校時代の友人から。
加持リョウジ
姓の「加持」は船の舵から。名の「リョウジ」は漫画『あいつ』(作：成田美名子)
の登場人物「沢田涼司」から。
一方、小説『愛と幻想のファシズム』（著：村上龍）の登場人物「山岸良治」説も。
碇ゲンドウ
庵野秀明の大学時代の友人の名前から。
ガイナックスで企画されながら実現しなかったアニメ
（管理人の予想：おそらくオネアミスの続編「蒼きウル」）の登場人物から。
碇ユイ
レイとの韻と、「唯」との掛詞。
冬月コウゾウ
大日本帝国海軍秋月型駆逐艦「冬月」から。名のコウゾウについては、
語呂の良さからついたもので由来はない。
伊吹マヤ
大日本帝国海軍航空母艦「伊吹」、
大日本帝国海軍高雄型重巡洋艦三番艦「摩耶（まや）」、
「帰ってきたウルトラマン」の伊吹竜MAT隊長から。
日向マコト
大日本帝国海軍伊勢型戦艦二番艦「日向」と
名の「マコト」は新撰組の誠字旗から。
青葉シゲル
大日本帝国海軍青葉型重巡洋艦一番艦「青葉」
名の「シゲル」は岡本喜八監督の映画『青葉茂れる』から。
鈴原トウジ
姓名ともに、村上龍の小説『愛と幻想のファシズム』(著:村上龍)の主人公
「鈴原冬二」から。
相田ケンスケ
姓名ともに、村上龍の小説『愛と幻想のファシズム』の主人公「相田剣介」から。
洞木ヒカリ
姓の「洞木」は小説『愛と幻想のファシズム』の登場人物「洞木紘一」から。
名は新幹線「ひかり」号から。
渚カヲル
映画監督の大島渚から（渚は海関係の言葉である）。
または姓を分けると「シ者」、すなわち使者（→使徒）であり死者、
名前は「オワリ」をアイウエオ順で1字後にずらしたものから「カヲル」、
姓と合わせると「シ者オワリ」→「渚カヲル」となる言葉遊び。
キール・ローレンツ
動物行動学者コンラート・ローレンツから。
時田シロウ
村上龍の小説『愛と幻想のファシズム』の登場人物、時田史郎から。
新劇場版
式波・アスカ・ラングレー
大日本帝国海軍の駆逐艦に敷波型の敷波（初代）、
綾波型とも呼ばれる吹雪型駆逐艦特II型の敷波（2代目）、
海上自衛隊の護衛艦にあやなみ型護衛艦のしきなみ から？
真希波・マリ・イラストリアス
日本姓の「真希波」については、大日本帝国海軍の駆逐艦に
夕雲型駆逐艦の5番艦「巻波」、
海上自衛隊の護衛艦にあやなみ型護衛艦の7番艦「まきなみ（初代）」、
たかなみ型護衛艦の3番艦「まきなみ（2代）」が存在する。
ファミリーネームの「イラストリアス」については、
英国海軍の艦艇に歴史上5隻存在する。
ゲーム版
ムサシ・リー・ストラスバーグ
大日本帝国海軍戦艦「武蔵」とアメリカの俳優・演出家
リー・ストラスバーグから。
浅利ケイタ
名前の由来は劇作家・演出家の浅利慶太から。
霧島マナ
名の「マナ」は映画『オネアミスの翼』でヒロインのリイクニと同居する少女マナ、及び「愛（＝マナ）」から。
山岸マユミ
「山岸」は村上龍の小説『愛と幻想のファシズム』の登場人物「山岸良治」から。
阿賀野カエデ
大日本帝国海軍軽巡洋艦「阿賀野」から。
名の「カエデ」は植物のカエデ、
もしくは帝国海軍樺級駆逐艦三番艦「楓」から。
大井サツキ
大日本帝国海軍軽巡洋艦「大井」から。
名の「サツキ」は植物のサツキ、
もしくは帝国海軍睦月級駆逐艦五番艦「皐月」から。
最上アオイ
大日本帝国海軍重巡洋艦「最上」から。
名の「アオイ」は帝国海軍樅級駆逐艦十番艦「葵」から。
剣崎キョウヤ
名前の由来は大日本帝国海軍剣埼型潜水母艦「剣埼（つるぎざき）」から。
加賀ヒトミ
名前の由来は大日本帝国海軍加賀型航空母艦「加賀」から。
参考資料：
・ウィキペディア「エヴァンゲリオン」
・EvaWiki
・漫画「新世紀エヴァンゲリオン」1巻
動画で紹介しているものも含めて載せます。
動画自体も元ネタの戦艦の画像とかあって楽しいですよ。
碇シンジ
苗字の由来は船の錨と
大学時代の友人で広告デザイナーの碇義彦から。
名のシンジは庵野の友人で『ふしぎの海のナディア』の監督を務めた
樋口真嗣から
綾波レイ
大日本帝國海軍特型駆逐艦II型一番艦「綾波」から。
名の「レイ」は『セーラームーン』の登場人物「火野レイ」からで、
また「零（れい）」との掛詞でもある。
惣流・アスカ・ラングレー
大日本帝国海軍航空母艦「蒼龍（そうりゅう）」とアメリカ合衆国海軍航空母艦
ラングレイ(CV-1)、ラングレー(CVL-27)
名の「アスカ」は漫画『超少女明日香』（著：和田慎二）の主人公
「砂姫明日香」から。
惣流・キョウコ・ツェッペリン
「キョウコ」は漫画『超少女明日香』（著：和田慎二）の登場人物
「葵今日子」から。
葛城ミサト
大日本帝国海軍雲龍型航空母艦三番艦「葛城」
名の「ミサト」は漫画『あいつ』（著:成田美名子）の登場人物「泉みさと」から。
赤木リツコ
大日本帝国海軍航空母艦「赤城（あかぎ）」と
名の「リツコ」は庵野秀明の中学時代の友人から。
赤木ナオコ
名の「ナオコ」は庵野秀明の小学校時代の友人から。
加持リョウジ
姓の「加持」は船の舵から。名の「リョウジ」は漫画『あいつ』(作：成田美名子)
の登場人物「沢田涼司」から。
一方、小説『愛と幻想のファシズム』（著：村上龍）の登場人物「山岸良治」説も。
碇ゲンドウ
庵野秀明の大学時代の友人の名前から。
ガイナックスで企画されながら実現しなかったアニメ
（管理人の予想：おそらくオネアミスの続編「蒼きウル」）の登場人物から。
碇ユイ
レイとの韻と、「唯」との掛詞。
冬月コウゾウ
大日本帝国海軍秋月型駆逐艦「冬月」から。名のコウゾウについては、
語呂の良さからついたもので由来はない。
伊吹マヤ
大日本帝国海軍航空母艦「伊吹」、
大日本帝国海軍高雄型重巡洋艦三番艦「摩耶（まや）」、
「帰ってきたウルトラマン」の伊吹竜MAT隊長から。
日向マコト
大日本帝国海軍伊勢型戦艦二番艦「日向」と
名の「マコト」は新撰組の誠字旗から。
青葉シゲル
大日本帝国海軍青葉型重巡洋艦一番艦「青葉」
名の「シゲル」は岡本喜八監督の映画『青葉茂れる』から。
鈴原トウジ
姓名ともに、村上龍の小説『愛と幻想のファシズム』(著:村上龍)の主人公
「鈴原冬二」から。
相田ケンスケ
姓名ともに、村上龍の小説『愛と幻想のファシズム』の主人公「相田剣介」から。
洞木ヒカリ
姓の「洞木」は小説『愛と幻想のファシズム』の登場人物「洞木紘一」から。
名は新幹線「ひかり」号から。
渚カヲル
映画監督の大島渚から（渚は海関係の言葉である）。
または姓を分けると「シ者」、すなわち使者（→使徒）であり死者、
名前は「オワリ」をアイウエオ順で1字後にずらしたものから「カヲル」、
姓と合わせると「シ者オワリ」→「渚カヲル」となる言葉遊び。
キール・ローレンツ
動物行動学者コンラート・ローレンツから。
時田シロウ
村上龍の小説『愛と幻想のファシズム』の登場人物、時田史郎から。
新劇場版
式波・アスカ・ラングレー
大日本帝国海軍の駆逐艦に敷波型の敷波（初代）、
綾波型とも呼ばれる吹雪型駆逐艦特II型の敷波（2代目）、
海上自衛隊の護衛艦にあやなみ型護衛艦のしきなみ から？
真希波・マリ・イラストリアス
日本姓の「真希波」については、大日本帝国海軍の駆逐艦に
夕雲型駆逐艦の5番艦「巻波」、
海上自衛隊の護衛艦にあやなみ型護衛艦の7番艦「まきなみ（初代）」、
たかなみ型護衛艦の3番艦「まきなみ（2代）」が存在する。
ファミリーネームの「イラストリアス」については、
英国海軍の艦艇に歴史上5隻存在する。
ゲーム版
ムサシ・リー・ストラスバーグ
大日本帝国海軍戦艦「武蔵」とアメリカの俳優・演出家
リー・ストラスバーグから。
浅利ケイタ
名前の由来は劇作家・演出家の浅利慶太から。
霧島マナ
名の「マナ」は映画『オネアミスの翼』でヒロインのリイクニと同居する少女マナ、及び「愛（＝マナ）」から。
山岸マユミ
「山岸」は村上龍の小説『愛と幻想のファシズム』の登場人物「山岸良治」から。
阿賀野カエデ
大日本帝国海軍軽巡洋艦「阿賀野」から。
名の「カエデ」は植物のカエデ、
もしくは帝国海軍樺級駆逐艦三番艦「楓」から。
大井サツキ
大日本帝国海軍軽巡洋艦「大井」から。
名の「サツキ」は植物のサツキ、
もしくは帝国海軍睦月級駆逐艦五番艦「皐月」から。
最上アオイ
大日本帝国海軍重巡洋艦「最上」から。
名の「アオイ」は帝国海軍樅級駆逐艦十番艦「葵」から。
剣崎キョウヤ
名前の由来は大日本帝国海軍剣埼型潜水母艦「剣埼（つるぎざき）」から。
加賀ヒトミ
名前の由来は大日本帝国海軍加賀型航空母艦「加賀」から。
参考資料：
・ウィキペディア「エヴァンゲリオン」
・EvaWiki
・漫画「新世紀エヴァンゲリオン」1巻