どこまでがリンクなのかAcrobatにキッチリ認識させる必要があります。
リンク末尾に半角スペースか改行を入れれば、ｈｔｔｐ：//からそこまでがリンクと認識できる。
URLによっては、途中に半角スペースを含んでいたりして、そこでリンクがきれてしまう。
その場合は、半角スペースを「%20」に置き換える。

ありがとうございます。

もしAcrobatが自動で判断してハイパーリンクを設定しているのならばそのような対策が容易に考えられるのですが、Wordでリンクの範囲と内容を設定した上での動作であり、かつ規則性が分からないために困っています。また、1行目のリンクがうまくいかない理由も分かりません。

また、例でのURLはすべて「http://www.microsoft.com/」という平凡なものです。

参考になれば、引用文ですけど。

Office2007よりWord文書や、ExcelブックがPDFファイルとして保存できるようになっています。

　ただし、“MicrosoftOfficeプログラム用MicrosoftPDF/XPS保存アドイン”をインストールしなくてはいけません。
　「Word文書などを大量に扱うため圧縮して保存したい」「PDFにしてメールで送信したい」「PDFとしてホームページにリンクしたい方」など。
　PDF作成ソフトを購入しなくて、また相性の問題など気にしなくて使えると思います。

　先ず、Officeボタン→名前を付けて保存（A)→ほかの形式用のアドインを探す→出てきたウインドウの「マイクロソフトの“PDFまたはXPSとして発行”アドインをインストールして使用する」
　をクリックしダウンロードし→開く（ダウンロード後自動インストール）または、保存（マイドキュメント等に保存後手動で実行）します。

　インストールがうまくゆくと、WordやExcelを起動し、Officeボタン→名前を付けて保存（A)→PDFまたはXPS（P)のメニューができています。
　これで次からPDFファイルの作成ができます。

ありがとうございます。

残念ながら環境が異なるので、直接の参考にはできませんでしたが…。

ところで、Word 2000のかわりにOpenOffice.orgのWriter 3.0を使っても同様の症状が出ることを確認しております。また、Acrobatの代わりにPrimoPDFを使っても同様の症状が出ることを確認しております。困ったものです。

回答3　非常に困っています氏

以下からの無断転載ですか。
http://pasonet.at.webry.info/200708/article_1.html

引用元を提示しておらず、本文と呼べるような本文がなく大半が転載元のコピーアンドペーストによる投稿ですので引用ではなく無断転載となります。
著作権を踏みにじるような行為は慎むべきです。
順法意識のない非常に困っています氏には以下を熟読の上、猛省を求めます。

http://web.webmeister-jp.com/management/basic/inyou.php